Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV6

HIST1H2AA, Histone H2A type 1-A, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H2AAQ96QV6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIST1H2AAQ96QV6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HIST1H2AAQ96QV6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST1H2AAQ96QV6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HIST1H2AAQ96QV6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HIST1H2AAQ96QV6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HIST1H2AAQ96QV6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HIST1H2AAQ96QV6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HIST1H2AAQ96QV6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HIST1H2AAQ96QV6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HIST1H2AAQ96QV6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HIST1H2AAQ96QV6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HIST1H2AAQ96QV6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIST1H2AAQ96QV6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIST1H2AAQ96QV6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIST1H2AAQ96QV6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HIST1H2AAQ96QV6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HIST1H2AAQ96QV6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HIST1H2AAQ96QV6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HIST1H2AAQ96QV6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIST1H2AAQ96QV6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIST1H2AAQ96QV6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HIST1H2AAQ96QV6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HIST1H2AAQ96QV6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HIST1H2AAQ96QV6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIST1H2AAQ96QV6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIST1H2AAQ96QV6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIST1H2AAQ96QV6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIST1H2AAQ96QV6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIST1H2AAQ96QV6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIST1H2AAQ96QV6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIST1H2AAQ96QV6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIST1H2AAQ96QV6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIST1H2AAQ96QV6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HIST1H2AAQ96QV6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HIST1H2AAQ96QV6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIST1H2AAQ96QV6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HIST1H2AAQ96QV6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HIST1H2AAQ96QV6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIST1H2AAQ96QV6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIST1H2AAQ96QV6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIST1H2AAQ96QV6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIST1H2AAQ96QV6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIST1H2AAQ96QV6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIST1H2AAQ96QV6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIST1H2AAQ96QV6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIST1H2AAQ96QV6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIST1H2AAQ96QV6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIST1H2AAQ96QV6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIST1H2AAQ96QV6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIST1H2AAQ96QV6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIST1H2AAQ96QV6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIST1H2AAQ96QV6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIST1H2AAQ96QV6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIST1H2AAQ96QV6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIST1H2AAQ96QV6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HIST1H2AAQ96QV6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIST1H2AAQ96QV6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIST1H2AAQ96QV6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HIST1H2AAQ96QV6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIST1H2AAQ96QV6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HIST1H2AAQ96QV6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIST1H2AAQ96QV6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIST1H2AAQ96QV6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIST1H2AAQ96QV6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIST1H2AAQ96QV6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HIST1H2AAQ96QV6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIST1H2AAQ96QV6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HIST1H2AAQ96QV6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HIST1H2AAQ96QV6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIST1H2AAQ96QV6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HIST1H2AAQ96QV6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HIST1H2AAQ96QV6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIST1H2AAQ96QV6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIST1H2AAQ96QV6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIST1H2AAQ96QV6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIST1H2AAQ96QV6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIST1H2AAQ96QV6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIST1H2AAQ96QV6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HIST1H2AAQ96QV6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIST1H2AAQ96QV6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIST1H2AAQ96QV6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIST1H2AAQ96QV6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIST1H2AAQ96QV6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIST1H2AAQ96QV6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIST1H2AAQ96QV6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIST1H2AAQ96QV6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIST1H2AAQ96QV6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIST1H2AAQ96QV6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIST1H2AAQ96QV6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIST1H2AAQ96QV6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIST1H2AAQ96QV6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIST1H2AAQ96QV6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIST1H2AAQ96QV6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIST1H2AAQ96QV6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIST1H2AAQ96QV6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIST1H2AAQ96QV6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIST1H2AAQ96QV6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIST1H2AAQ96QV6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIST1H2AAQ96QV6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms