Protein–RNA interactions for Protein: Q96NI6

LRFN5, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN5Q96NI6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRFN5Q96NI6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRFN5Q96NI6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LRFN5Q96NI6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRFN5Q96NI6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRFN5Q96NI6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRFN5Q96NI6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRFN5Q96NI6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRFN5Q96NI6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRFN5Q96NI6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRFN5Q96NI6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRFN5Q96NI6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRFN5Q96NI6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRFN5Q96NI6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRFN5Q96NI6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LRFN5Q96NI6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRFN5Q96NI6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRFN5Q96NI6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRFN5Q96NI6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRFN5Q96NI6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LRFN5Q96NI6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRFN5Q96NI6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRFN5Q96NI6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRFN5Q96NI6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRFN5Q96NI6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRFN5Q96NI6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRFN5Q96NI6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRFN5Q96NI6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LRFN5Q96NI6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRFN5Q96NI6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRFN5Q96NI6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRFN5Q96NI6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRFN5Q96NI6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRFN5Q96NI6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRFN5Q96NI6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRFN5Q96NI6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRFN5Q96NI6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRFN5Q96NI6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRFN5Q96NI6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRFN5Q96NI6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRFN5Q96NI6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRFN5Q96NI6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRFN5Q96NI6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRFN5Q96NI6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRFN5Q96NI6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRFN5Q96NI6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRFN5Q96NI6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRFN5Q96NI6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRFN5Q96NI6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRFN5Q96NI6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LRFN5Q96NI6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LRFN5Q96NI6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRFN5Q96NI6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRFN5Q96NI6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LRFN5Q96NI6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRFN5Q96NI6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRFN5Q96NI6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRFN5Q96NI6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRFN5Q96NI6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LRFN5Q96NI6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRFN5Q96NI6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRFN5Q96NI6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRFN5Q96NI6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRFN5Q96NI6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRFN5Q96NI6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRFN5Q96NI6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LRFN5Q96NI6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRFN5Q96NI6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRFN5Q96NI6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRFN5Q96NI6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRFN5Q96NI6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRFN5Q96NI6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRFN5Q96NI6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRFN5Q96NI6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRFN5Q96NI6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRFN5Q96NI6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRFN5Q96NI6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRFN5Q96NI6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRFN5Q96NI6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRFN5Q96NI6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LRFN5Q96NI6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRFN5Q96NI6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRFN5Q96NI6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRFN5Q96NI6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRFN5Q96NI6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRFN5Q96NI6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LRFN5Q96NI6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRFN5Q96NI6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRFN5Q96NI6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRFN5Q96NI6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRFN5Q96NI6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRFN5Q96NI6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRFN5Q96NI6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRFN5Q96NI6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRFN5Q96NI6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LRFN5Q96NI6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRFN5Q96NI6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRFN5Q96NI6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRFN5Q96NI6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRFN5Q96NI6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms