Protein–RNA interactions for Protein: Q96NE9

FRMD6, FERM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6Q96NE9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FRMD6Q96NE9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FRMD6Q96NE9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FRMD6Q96NE9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FRMD6Q96NE9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FRMD6Q96NE9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FRMD6Q96NE9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FRMD6Q96NE9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRMD6Q96NE9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRMD6Q96NE9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FRMD6Q96NE9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRMD6Q96NE9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMD6Q96NE9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMD6Q96NE9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMD6Q96NE9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMD6Q96NE9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMD6Q96NE9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMD6Q96NE9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMD6Q96NE9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMD6Q96NE9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMD6Q96NE9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMD6Q96NE9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRMD6Q96NE9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRMD6Q96NE9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRMD6Q96NE9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMD6Q96NE9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMD6Q96NE9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMD6Q96NE9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMD6Q96NE9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMD6Q96NE9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMD6Q96NE9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMD6Q96NE9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMD6Q96NE9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FRMD6Q96NE9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FRMD6Q96NE9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMD6Q96NE9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMD6Q96NE9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMD6Q96NE9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMD6Q96NE9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FRMD6Q96NE9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FRMD6Q96NE9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
FRMD6Q96NE9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FRMD6Q96NE9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FRMD6Q96NE9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FRMD6Q96NE9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FRMD6Q96NE9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMD6Q96NE9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMD6Q96NE9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FRMD6Q96NE9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMD6Q96NE9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FRMD6Q96NE9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FRMD6Q96NE9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMD6Q96NE9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FRMD6Q96NE9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMD6Q96NE9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMD6Q96NE9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMD6Q96NE9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FRMD6Q96NE9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FRMD6Q96NE9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRMD6Q96NE9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRMD6Q96NE9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRMD6Q96NE9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FRMD6Q96NE9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRMD6Q96NE9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FRMD6Q96NE9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FRMD6Q96NE9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRMD6Q96NE9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRMD6Q96NE9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FRMD6Q96NE9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMD6Q96NE9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMD6Q96NE9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FRMD6Q96NE9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMD6Q96NE9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMD6Q96NE9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMD6Q96NE9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FRMD6Q96NE9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FRMD6Q96NE9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMD6Q96NE9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMD6Q96NE9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FRMD6Q96NE9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMD6Q96NE9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FRMD6Q96NE9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FRMD6Q96NE9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMD6Q96NE9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMD6Q96NE9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMD6Q96NE9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMD6Q96NE9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMD6Q96NE9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FRMD6Q96NE9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMD6Q96NE9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FRMD6Q96NE9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMD6Q96NE9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMD6Q96NE9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMD6Q96NE9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMD6Q96NE9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMD6Q96NE9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMD6Q96NE9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMD6Q96NE9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FRMD6Q96NE9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FRMD6Q96NE9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms