Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN5

TCEANC2, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEANC2Q96MN5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TCEANC2Q96MN5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
TCEANC2Q96MN5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TCEANC2Q96MN5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TCEANC2Q96MN5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TCEANC2Q96MN5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TCEANC2Q96MN5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TCEANC2Q96MN5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TCEANC2Q96MN5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TCEANC2Q96MN5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TCEANC2Q96MN5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TCEANC2Q96MN5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TCEANC2Q96MN5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TCEANC2Q96MN5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TCEANC2Q96MN5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TCEANC2Q96MN5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TCEANC2Q96MN5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
TCEANC2Q96MN5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TCEANC2Q96MN5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TCEANC2Q96MN5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TCEANC2Q96MN5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TCEANC2Q96MN5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TCEANC2Q96MN5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TCEANC2Q96MN5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TCEANC2Q96MN5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TCEANC2Q96MN5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TCEANC2Q96MN5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TCEANC2Q96MN5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TCEANC2Q96MN5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TCEANC2Q96MN5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TCEANC2Q96MN5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TCEANC2Q96MN5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TCEANC2Q96MN5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TCEANC2Q96MN5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
TCEANC2Q96MN5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
TCEANC2Q96MN5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TCEANC2Q96MN5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TCEANC2Q96MN5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TCEANC2Q96MN5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TCEANC2Q96MN5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TCEANC2Q96MN5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TCEANC2Q96MN5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TCEANC2Q96MN5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TCEANC2Q96MN5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TCEANC2Q96MN5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TCEANC2Q96MN5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TCEANC2Q96MN5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TCEANC2Q96MN5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TCEANC2Q96MN5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TCEANC2Q96MN5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TCEANC2Q96MN5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TCEANC2Q96MN5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TCEANC2Q96MN5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
TCEANC2Q96MN5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TCEANC2Q96MN5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TCEANC2Q96MN5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TCEANC2Q96MN5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TCEANC2Q96MN5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TCEANC2Q96MN5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TCEANC2Q96MN5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TCEANC2Q96MN5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TCEANC2Q96MN5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TCEANC2Q96MN5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TCEANC2Q96MN5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TCEANC2Q96MN5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TCEANC2Q96MN5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TCEANC2Q96MN5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TCEANC2Q96MN5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
TCEANC2Q96MN5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TCEANC2Q96MN5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TCEANC2Q96MN5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TCEANC2Q96MN5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TCEANC2Q96MN5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TCEANC2Q96MN5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TCEANC2Q96MN5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TCEANC2Q96MN5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TCEANC2Q96MN5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TCEANC2Q96MN5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TCEANC2Q96MN5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TCEANC2Q96MN5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TCEANC2Q96MN5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TCEANC2Q96MN5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TCEANC2Q96MN5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TCEANC2Q96MN5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TCEANC2Q96MN5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TCEANC2Q96MN5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TCEANC2Q96MN5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TCEANC2Q96MN5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TCEANC2Q96MN5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TCEANC2Q96MN5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
TCEANC2Q96MN5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TCEANC2Q96MN5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TCEANC2Q96MN5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TCEANC2Q96MN5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TCEANC2Q96MN5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TCEANC2Q96MN5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TCEANC2Q96MN5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TCEANC2Q96MN5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TCEANC2Q96MN5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TCEANC2Q96MN5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms