Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL15Q96M94 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL15Q96M94 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL15Q96M94 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL15Q96M94 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL15Q96M94 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL15Q96M94 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL15Q96M94 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL15Q96M94 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL15Q96M94 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL15Q96M94 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL15Q96M94 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL15Q96M94 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL15Q96M94 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL15Q96M94 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL15Q96M94 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL15Q96M94 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL15Q96M94 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL15Q96M94 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL15Q96M94 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL15Q96M94 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL15Q96M94 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL15Q96M94 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL15Q96M94 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL15Q96M94 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL15Q96M94 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL15Q96M94 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL15Q96M94 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL15Q96M94 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL15Q96M94 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL15Q96M94 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL15Q96M94 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL15Q96M94 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL15Q96M94 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL15Q96M94 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL15Q96M94 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL15Q96M94 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL15Q96M94 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KLHL15Q96M94 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL15Q96M94 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL15Q96M94 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL15Q96M94 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL15Q96M94 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL15Q96M94 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL15Q96M94 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL15Q96M94 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL15Q96M94 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL15Q96M94 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL15Q96M94 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL15Q96M94 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL15Q96M94 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL15Q96M94 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL15Q96M94 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL15Q96M94 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL15Q96M94 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL15Q96M94 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL15Q96M94 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL15Q96M94 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL15Q96M94 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL15Q96M94 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL15Q96M94 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL15Q96M94 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL15Q96M94 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL15Q96M94 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL15Q96M94 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL15Q96M94 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL15Q96M94 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL15Q96M94 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL15Q96M94 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL15Q96M94 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL15Q96M94 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL15Q96M94 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL15Q96M94 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL15Q96M94 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL15Q96M94 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL15Q96M94 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL15Q96M94 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL15Q96M94 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL15Q96M94 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL15Q96M94 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL15Q96M94 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL15Q96M94 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL15Q96M94 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL15Q96M94 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL15Q96M94 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL15Q96M94 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL15Q96M94 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL15Q96M94 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL15Q96M94 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL15Q96M94 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL15Q96M94 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL15Q96M94 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL15Q96M94 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL15Q96M94 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KLHL15Q96M94 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL15Q96M94 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL15Q96M94 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL15Q96M94 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL15Q96M94 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL15Q96M94 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms