Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CAPNS2Q96L46 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CAPNS2Q96L46 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
CAPNS2Q96L46 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CAPNS2Q96L46 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CAPNS2Q96L46 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CAPNS2Q96L46 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CAPNS2Q96L46 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CAPNS2Q96L46 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CAPNS2Q96L46 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CAPNS2Q96L46 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CAPNS2Q96L46 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CAPNS2Q96L46 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CAPNS2Q96L46 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CAPNS2Q96L46 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CAPNS2Q96L46 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CAPNS2Q96L46 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CAPNS2Q96L46 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CAPNS2Q96L46 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CAPNS2Q96L46 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CAPNS2Q96L46 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CAPNS2Q96L46 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CAPNS2Q96L46 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CAPNS2Q96L46 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CAPNS2Q96L46 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CAPNS2Q96L46 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CAPNS2Q96L46 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CAPNS2Q96L46 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CAPNS2Q96L46 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CAPNS2Q96L46 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CAPNS2Q96L46 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CAPNS2Q96L46 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CAPNS2Q96L46 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CAPNS2Q96L46 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CAPNS2Q96L46 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CAPNS2Q96L46 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CAPNS2Q96L46 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CAPNS2Q96L46 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CAPNS2Q96L46 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CAPNS2Q96L46 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CAPNS2Q96L46 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CAPNS2Q96L46 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CAPNS2Q96L46 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CAPNS2Q96L46 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CAPNS2Q96L46 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CAPNS2Q96L46 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
CAPNS2Q96L46 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CAPNS2Q96L46 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CAPNS2Q96L46 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CAPNS2Q96L46 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CAPNS2Q96L46 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CAPNS2Q96L46 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CAPNS2Q96L46 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CAPNS2Q96L46 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CAPNS2Q96L46 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CAPNS2Q96L46 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CAPNS2Q96L46 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CAPNS2Q96L46 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CAPNS2Q96L46 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CAPNS2Q96L46 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CAPNS2Q96L46 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CAPNS2Q96L46 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CAPNS2Q96L46 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CAPNS2Q96L46 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CAPNS2Q96L46 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CAPNS2Q96L46 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CAPNS2Q96L46 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CAPNS2Q96L46 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CAPNS2Q96L46 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CAPNS2Q96L46 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CAPNS2Q96L46 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CAPNS2Q96L46 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CAPNS2Q96L46 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CAPNS2Q96L46 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CAPNS2Q96L46 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CAPNS2Q96L46 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CAPNS2Q96L46 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CAPNS2Q96L46 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CAPNS2Q96L46 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
CAPNS2Q96L46 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CAPNS2Q96L46 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CAPNS2Q96L46 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CAPNS2Q96L46 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CAPNS2Q96L46 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CAPNS2Q96L46 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
CAPNS2Q96L46 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CAPNS2Q96L46 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CAPNS2Q96L46 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CAPNS2Q96L46 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CAPNS2Q96L46 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CAPNS2Q96L46 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
CAPNS2Q96L46 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CAPNS2Q96L46 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CAPNS2Q96L46 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CAPNS2Q96L46 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CAPNS2Q96L46 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CAPNS2Q96L46 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CAPNS2Q96L46 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CAPNS2Q96L46 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CAPNS2Q96L46 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms