Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CAPZA3Q96KX2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CAPZA3Q96KX2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CAPZA3Q96KX2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CAPZA3Q96KX2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CAPZA3Q96KX2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CAPZA3Q96KX2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CAPZA3Q96KX2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CAPZA3Q96KX2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CAPZA3Q96KX2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CAPZA3Q96KX2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAPZA3Q96KX2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAPZA3Q96KX2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CAPZA3Q96KX2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CAPZA3Q96KX2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CAPZA3Q96KX2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CAPZA3Q96KX2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CAPZA3Q96KX2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAPZA3Q96KX2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAPZA3Q96KX2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAPZA3Q96KX2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAPZA3Q96KX2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAPZA3Q96KX2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAPZA3Q96KX2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAPZA3Q96KX2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CAPZA3Q96KX2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAPZA3Q96KX2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAPZA3Q96KX2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAPZA3Q96KX2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAPZA3Q96KX2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CAPZA3Q96KX2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAPZA3Q96KX2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CAPZA3Q96KX2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CAPZA3Q96KX2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAPZA3Q96KX2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAPZA3Q96KX2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAPZA3Q96KX2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAPZA3Q96KX2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAPZA3Q96KX2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CAPZA3Q96KX2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAPZA3Q96KX2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAPZA3Q96KX2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAPZA3Q96KX2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAPZA3Q96KX2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAPZA3Q96KX2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAPZA3Q96KX2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAPZA3Q96KX2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAPZA3Q96KX2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAPZA3Q96KX2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CAPZA3Q96KX2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAPZA3Q96KX2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAPZA3Q96KX2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAPZA3Q96KX2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAPZA3Q96KX2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAPZA3Q96KX2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAPZA3Q96KX2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAPZA3Q96KX2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CAPZA3Q96KX2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CAPZA3Q96KX2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAPZA3Q96KX2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CAPZA3Q96KX2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CAPZA3Q96KX2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CAPZA3Q96KX2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CAPZA3Q96KX2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CAPZA3Q96KX2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CAPZA3Q96KX2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAPZA3Q96KX2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAPZA3Q96KX2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CAPZA3Q96KX2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CAPZA3Q96KX2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAPZA3Q96KX2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAPZA3Q96KX2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CAPZA3Q96KX2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAPZA3Q96KX2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAPZA3Q96KX2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CAPZA3Q96KX2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CAPZA3Q96KX2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CAPZA3Q96KX2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CAPZA3Q96KX2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAPZA3Q96KX2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAPZA3Q96KX2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAPZA3Q96KX2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAPZA3Q96KX2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAPZA3Q96KX2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAPZA3Q96KX2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAPZA3Q96KX2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAPZA3Q96KX2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAPZA3Q96KX2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAPZA3Q96KX2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAPZA3Q96KX2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAPZA3Q96KX2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAPZA3Q96KX2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAPZA3Q96KX2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPZA3Q96KX2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAPZA3Q96KX2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAPZA3Q96KX2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAPZA3Q96KX2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAPZA3Q96KX2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAPZA3Q96KX2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAPZA3Q96KX2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms