Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PGBD1Q96JS3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PGBD1Q96JS3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PGBD1Q96JS3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PGBD1Q96JS3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PGBD1Q96JS3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PGBD1Q96JS3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PGBD1Q96JS3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PGBD1Q96JS3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PGBD1Q96JS3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PGBD1Q96JS3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PGBD1Q96JS3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PGBD1Q96JS3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PGBD1Q96JS3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PGBD1Q96JS3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PGBD1Q96JS3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PGBD1Q96JS3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PGBD1Q96JS3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PGBD1Q96JS3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PGBD1Q96JS3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PGBD1Q96JS3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PGBD1Q96JS3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PGBD1Q96JS3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PGBD1Q96JS3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PGBD1Q96JS3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PGBD1Q96JS3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PGBD1Q96JS3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PGBD1Q96JS3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PGBD1Q96JS3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PGBD1Q96JS3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PGBD1Q96JS3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PGBD1Q96JS3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PGBD1Q96JS3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PGBD1Q96JS3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PGBD1Q96JS3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PGBD1Q96JS3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PGBD1Q96JS3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PGBD1Q96JS3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PGBD1Q96JS3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PGBD1Q96JS3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PGBD1Q96JS3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PGBD1Q96JS3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PGBD1Q96JS3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PGBD1Q96JS3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PGBD1Q96JS3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PGBD1Q96JS3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PGBD1Q96JS3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PGBD1Q96JS3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PGBD1Q96JS3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PGBD1Q96JS3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
PGBD1Q96JS3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PGBD1Q96JS3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PGBD1Q96JS3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PGBD1Q96JS3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PGBD1Q96JS3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PGBD1Q96JS3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PGBD1Q96JS3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PGBD1Q96JS3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PGBD1Q96JS3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PGBD1Q96JS3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PGBD1Q96JS3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
PGBD1Q96JS3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PGBD1Q96JS3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PGBD1Q96JS3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PGBD1Q96JS3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PGBD1Q96JS3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
PGBD1Q96JS3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PGBD1Q96JS3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PGBD1Q96JS3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PGBD1Q96JS3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PGBD1Q96JS3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PGBD1Q96JS3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PGBD1Q96JS3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PGBD1Q96JS3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PGBD1Q96JS3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PGBD1Q96JS3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PGBD1Q96JS3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PGBD1Q96JS3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PGBD1Q96JS3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PGBD1Q96JS3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PGBD1Q96JS3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PGBD1Q96JS3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PGBD1Q96JS3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PGBD1Q96JS3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PGBD1Q96JS3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
PGBD1Q96JS3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PGBD1Q96JS3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PGBD1Q96JS3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
PGBD1Q96JS3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PGBD1Q96JS3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PGBD1Q96JS3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PGBD1Q96JS3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PGBD1Q96JS3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PGBD1Q96JS3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PGBD1Q96JS3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PGBD1Q96JS3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PGBD1Q96JS3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PGBD1Q96JS3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PGBD1Q96JS3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
PGBD1Q96JS3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms