Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VPS50Q96JG6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VPS50Q96JG6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS50Q96JG6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS50Q96JG6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS50Q96JG6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS50Q96JG6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS50Q96JG6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS50Q96JG6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS50Q96JG6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS50Q96JG6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS50Q96JG6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS50Q96JG6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS50Q96JG6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS50Q96JG6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS50Q96JG6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS50Q96JG6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS50Q96JG6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS50Q96JG6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS50Q96JG6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS50Q96JG6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS50Q96JG6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS50Q96JG6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS50Q96JG6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS50Q96JG6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS50Q96JG6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS50Q96JG6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS50Q96JG6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS50Q96JG6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS50Q96JG6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS50Q96JG6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS50Q96JG6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VPS50Q96JG6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VPS50Q96JG6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
VPS50Q96JG6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VPS50Q96JG6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS50Q96JG6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS50Q96JG6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VPS50Q96JG6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS50Q96JG6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS50Q96JG6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS50Q96JG6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VPS50Q96JG6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VPS50Q96JG6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VPS50Q96JG6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VPS50Q96JG6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VPS50Q96JG6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS50Q96JG6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS50Q96JG6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS50Q96JG6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS50Q96JG6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS50Q96JG6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS50Q96JG6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS50Q96JG6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VPS50Q96JG6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS50Q96JG6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS50Q96JG6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS50Q96JG6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS50Q96JG6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS50Q96JG6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS50Q96JG6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS50Q96JG6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS50Q96JG6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS50Q96JG6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS50Q96JG6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS50Q96JG6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS50Q96JG6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS50Q96JG6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS50Q96JG6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS50Q96JG6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS50Q96JG6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS50Q96JG6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS50Q96JG6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS50Q96JG6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS50Q96JG6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS50Q96JG6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS50Q96JG6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS50Q96JG6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS50Q96JG6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS50Q96JG6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS50Q96JG6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS50Q96JG6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS50Q96JG6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS50Q96JG6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS50Q96JG6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS50Q96JG6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS50Q96JG6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS50Q96JG6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS50Q96JG6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS50Q96JG6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS50Q96JG6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS50Q96JG6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS50Q96JG6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS50Q96JG6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS50Q96JG6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS50Q96JG6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS50Q96JG6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS50Q96JG6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS50Q96JG6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS50Q96JG6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms