Protein–RNA interactions for Protein: Q96JE7

SEC16B, Protein transport protein Sec16B, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16BQ96JE7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SEC16BQ96JE7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SEC16BQ96JE7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SEC16BQ96JE7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SEC16BQ96JE7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SEC16BQ96JE7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SEC16BQ96JE7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEC16BQ96JE7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEC16BQ96JE7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEC16BQ96JE7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SEC16BQ96JE7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEC16BQ96JE7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SEC16BQ96JE7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEC16BQ96JE7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SEC16BQ96JE7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC16BQ96JE7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SEC16BQ96JE7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC16BQ96JE7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEC16BQ96JE7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEC16BQ96JE7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SEC16BQ96JE7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEC16BQ96JE7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEC16BQ96JE7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEC16BQ96JE7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEC16BQ96JE7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEC16BQ96JE7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC16BQ96JE7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC16BQ96JE7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC16BQ96JE7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC16BQ96JE7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEC16BQ96JE7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC16BQ96JE7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC16BQ96JE7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC16BQ96JE7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC16BQ96JE7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEC16BQ96JE7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC16BQ96JE7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEC16BQ96JE7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SEC16BQ96JE7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SEC16BQ96JE7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SEC16BQ96JE7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SEC16BQ96JE7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEC16BQ96JE7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEC16BQ96JE7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEC16BQ96JE7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SEC16BQ96JE7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEC16BQ96JE7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SEC16BQ96JE7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEC16BQ96JE7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SEC16BQ96JE7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SEC16BQ96JE7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SEC16BQ96JE7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEC16BQ96JE7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SEC16BQ96JE7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC16BQ96JE7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC16BQ96JE7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEC16BQ96JE7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEC16BQ96JE7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEC16BQ96JE7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEC16BQ96JE7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEC16BQ96JE7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SEC16BQ96JE7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEC16BQ96JE7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEC16BQ96JE7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEC16BQ96JE7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SEC16BQ96JE7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEC16BQ96JE7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEC16BQ96JE7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEC16BQ96JE7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEC16BQ96JE7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEC16BQ96JE7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEC16BQ96JE7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEC16BQ96JE7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEC16BQ96JE7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEC16BQ96JE7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SEC16BQ96JE7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEC16BQ96JE7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SEC16BQ96JE7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SEC16BQ96JE7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEC16BQ96JE7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEC16BQ96JE7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC16BQ96JE7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC16BQ96JE7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEC16BQ96JE7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC16BQ96JE7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC16BQ96JE7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEC16BQ96JE7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEC16BQ96JE7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SEC16BQ96JE7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEC16BQ96JE7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEC16BQ96JE7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SEC16BQ96JE7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC16BQ96JE7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC16BQ96JE7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC16BQ96JE7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEC16BQ96JE7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEC16BQ96JE7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEC16BQ96JE7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEC16BQ96JE7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEC16BQ96JE7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms