Protein–RNA interactions for Protein: Q96F07

CYFIP2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP2Q96F07 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CYFIP2Q96F07 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CYFIP2Q96F07 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CYFIP2Q96F07 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CYFIP2Q96F07 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CYFIP2Q96F07 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CYFIP2Q96F07 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CYFIP2Q96F07 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CYFIP2Q96F07 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CYFIP2Q96F07 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CYFIP2Q96F07 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CYFIP2Q96F07 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CYFIP2Q96F07 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CYFIP2Q96F07 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CYFIP2Q96F07 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CYFIP2Q96F07 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CYFIP2Q96F07 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CYFIP2Q96F07 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CYFIP2Q96F07 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CYFIP2Q96F07 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CYFIP2Q96F07 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CYFIP2Q96F07 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CYFIP2Q96F07 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CYFIP2Q96F07 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CYFIP2Q96F07 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CYFIP2Q96F07 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CYFIP2Q96F07 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CYFIP2Q96F07 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CYFIP2Q96F07 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CYFIP2Q96F07 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CYFIP2Q96F07 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CYFIP2Q96F07 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CYFIP2Q96F07 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CYFIP2Q96F07 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CYFIP2Q96F07 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CYFIP2Q96F07 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CYFIP2Q96F07 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CYFIP2Q96F07 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CYFIP2Q96F07 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CYFIP2Q96F07 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CYFIP2Q96F07 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CYFIP2Q96F07 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CYFIP2Q96F07 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CYFIP2Q96F07 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CYFIP2Q96F07 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CYFIP2Q96F07 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CYFIP2Q96F07 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CYFIP2Q96F07 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CYFIP2Q96F07 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CYFIP2Q96F07 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CYFIP2Q96F07 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CYFIP2Q96F07 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CYFIP2Q96F07 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CYFIP2Q96F07 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CYFIP2Q96F07 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CYFIP2Q96F07 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CYFIP2Q96F07 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CYFIP2Q96F07 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CYFIP2Q96F07 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CYFIP2Q96F07 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CYFIP2Q96F07 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CYFIP2Q96F07 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CYFIP2Q96F07 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CYFIP2Q96F07 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CYFIP2Q96F07 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CYFIP2Q96F07 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CYFIP2Q96F07 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CYFIP2Q96F07 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CYFIP2Q96F07 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CYFIP2Q96F07 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CYFIP2Q96F07 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CYFIP2Q96F07 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CYFIP2Q96F07 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CYFIP2Q96F07 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CYFIP2Q96F07 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CYFIP2Q96F07 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CYFIP2Q96F07 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CYFIP2Q96F07 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CYFIP2Q96F07 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CYFIP2Q96F07 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CYFIP2Q96F07 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CYFIP2Q96F07 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CYFIP2Q96F07 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.1 ms