Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SGF29Q96ES7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SGF29Q96ES7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SGF29Q96ES7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SGF29Q96ES7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SGF29Q96ES7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SGF29Q96ES7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGF29Q96ES7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SGF29Q96ES7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGF29Q96ES7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SGF29Q96ES7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SGF29Q96ES7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SGF29Q96ES7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SGF29Q96ES7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SGF29Q96ES7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SGF29Q96ES7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SGF29Q96ES7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SGF29Q96ES7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGF29Q96ES7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGF29Q96ES7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGF29Q96ES7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SGF29Q96ES7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SGF29Q96ES7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SGF29Q96ES7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SGF29Q96ES7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SGF29Q96ES7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SGF29Q96ES7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SGF29Q96ES7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SGF29Q96ES7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SGF29Q96ES7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGF29Q96ES7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SGF29Q96ES7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SGF29Q96ES7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SGF29Q96ES7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGF29Q96ES7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SGF29Q96ES7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SGF29Q96ES7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SGF29Q96ES7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SGF29Q96ES7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SGF29Q96ES7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGF29Q96ES7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SGF29Q96ES7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SGF29Q96ES7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SGF29Q96ES7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SGF29Q96ES7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SGF29Q96ES7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SGF29Q96ES7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SGF29Q96ES7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SGF29Q96ES7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SGF29Q96ES7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SGF29Q96ES7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SGF29Q96ES7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SGF29Q96ES7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SGF29Q96ES7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SGF29Q96ES7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SGF29Q96ES7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SGF29Q96ES7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SGF29Q96ES7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SGF29Q96ES7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SGF29Q96ES7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SGF29Q96ES7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SGF29Q96ES7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SGF29Q96ES7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SGF29Q96ES7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SGF29Q96ES7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SGF29Q96ES7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SGF29Q96ES7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SGF29Q96ES7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SGF29Q96ES7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SGF29Q96ES7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SGF29Q96ES7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SGF29Q96ES7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SGF29Q96ES7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SGF29Q96ES7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SGF29Q96ES7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SGF29Q96ES7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SGF29Q96ES7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SGF29Q96ES7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SGF29Q96ES7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SGF29Q96ES7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SGF29Q96ES7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SGF29Q96ES7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SGF29Q96ES7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SGF29Q96ES7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SGF29Q96ES7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SGF29Q96ES7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SGF29Q96ES7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SGF29Q96ES7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SGF29Q96ES7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SGF29Q96ES7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SGF29Q96ES7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SGF29Q96ES7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SGF29Q96ES7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SGF29Q96ES7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SGF29Q96ES7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SGF29Q96ES7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SGF29Q96ES7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SGF29Q96ES7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SGF29Q96ES7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SGF29Q96ES7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms