Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
C18orf8Q96DM3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
C18orf8Q96DM3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
C18orf8Q96DM3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
C18orf8Q96DM3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
C18orf8Q96DM3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
C18orf8Q96DM3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
C18orf8Q96DM3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
C18orf8Q96DM3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
C18orf8Q96DM3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
C18orf8Q96DM3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
C18orf8Q96DM3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
C18orf8Q96DM3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
C18orf8Q96DM3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
C18orf8Q96DM3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
C18orf8Q96DM3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
C18orf8Q96DM3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
C18orf8Q96DM3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
C18orf8Q96DM3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
C18orf8Q96DM3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
C18orf8Q96DM3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
C18orf8Q96DM3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
C18orf8Q96DM3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
C18orf8Q96DM3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
C18orf8Q96DM3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
C18orf8Q96DM3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
C18orf8Q96DM3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
C18orf8Q96DM3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
C18orf8Q96DM3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C18orf8Q96DM3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
C18orf8Q96DM3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
C18orf8Q96DM3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
C18orf8Q96DM3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
C18orf8Q96DM3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
C18orf8Q96DM3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
C18orf8Q96DM3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
C18orf8Q96DM3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
C18orf8Q96DM3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
C18orf8Q96DM3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
C18orf8Q96DM3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
C18orf8Q96DM3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
C18orf8Q96DM3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
C18orf8Q96DM3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
C18orf8Q96DM3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C18orf8Q96DM3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
C18orf8Q96DM3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
C18orf8Q96DM3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C18orf8Q96DM3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
C18orf8Q96DM3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
C18orf8Q96DM3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
C18orf8Q96DM3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
C18orf8Q96DM3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
C18orf8Q96DM3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
C18orf8Q96DM3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
C18orf8Q96DM3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
C18orf8Q96DM3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
C18orf8Q96DM3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
C18orf8Q96DM3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
C18orf8Q96DM3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
C18orf8Q96DM3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
C18orf8Q96DM3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
C18orf8Q96DM3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
C18orf8Q96DM3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
C18orf8Q96DM3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
C18orf8Q96DM3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
C18orf8Q96DM3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
C18orf8Q96DM3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C18orf8Q96DM3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
C18orf8Q96DM3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
C18orf8Q96DM3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C18orf8Q96DM3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C18orf8Q96DM3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
C18orf8Q96DM3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
C18orf8Q96DM3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
C18orf8Q96DM3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
C18orf8Q96DM3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
C18orf8Q96DM3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
C18orf8Q96DM3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
C18orf8Q96DM3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
C18orf8Q96DM3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
C18orf8Q96DM3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
C18orf8Q96DM3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
C18orf8Q96DM3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
C18orf8Q96DM3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
C18orf8Q96DM3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
C18orf8Q96DM3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
C18orf8Q96DM3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
C18orf8Q96DM3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
C18orf8Q96DM3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
C18orf8Q96DM3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
C18orf8Q96DM3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C18orf8Q96DM3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
C18orf8Q96DM3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
C18orf8Q96DM3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
C18orf8Q96DM3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
C18orf8Q96DM3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
C18orf8Q96DM3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
C18orf8Q96DM3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
C18orf8Q96DM3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
C18orf8Q96DM3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms