Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RCN3Q96D15 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RCN3Q96D15 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RCN3Q96D15 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RCN3Q96D15 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RCN3Q96D15 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RCN3Q96D15 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RCN3Q96D15 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RCN3Q96D15 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RCN3Q96D15 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RCN3Q96D15 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RCN3Q96D15 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RCN3Q96D15 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RCN3Q96D15 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RCN3Q96D15 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RCN3Q96D15 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RCN3Q96D15 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RCN3Q96D15 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RCN3Q96D15 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RCN3Q96D15 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RCN3Q96D15 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCN3Q96D15 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RCN3Q96D15 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCN3Q96D15 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCN3Q96D15 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RCN3Q96D15 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RCN3Q96D15 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RCN3Q96D15 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RCN3Q96D15 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RCN3Q96D15 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RCN3Q96D15 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RCN3Q96D15 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RCN3Q96D15 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RCN3Q96D15 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RCN3Q96D15 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RCN3Q96D15 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RCN3Q96D15 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RCN3Q96D15 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RCN3Q96D15 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RCN3Q96D15 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RCN3Q96D15 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RCN3Q96D15 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RCN3Q96D15 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RCN3Q96D15 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RCN3Q96D15 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RCN3Q96D15 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RCN3Q96D15 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RCN3Q96D15 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RCN3Q96D15 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RCN3Q96D15 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RCN3Q96D15 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RCN3Q96D15 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RCN3Q96D15 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RCN3Q96D15 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RCN3Q96D15 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RCN3Q96D15 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RCN3Q96D15 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RCN3Q96D15 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RCN3Q96D15 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RCN3Q96D15 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RCN3Q96D15 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RCN3Q96D15 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RCN3Q96D15 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RCN3Q96D15 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RCN3Q96D15 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RCN3Q96D15 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RCN3Q96D15 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RCN3Q96D15 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RCN3Q96D15 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RCN3Q96D15 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RCN3Q96D15 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RCN3Q96D15 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RCN3Q96D15 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RCN3Q96D15 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RCN3Q96D15 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RCN3Q96D15 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RCN3Q96D15 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RCN3Q96D15 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RCN3Q96D15 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RCN3Q96D15 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RCN3Q96D15 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RCN3Q96D15 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RCN3Q96D15 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RCN3Q96D15 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RCN3Q96D15 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RCN3Q96D15 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCN3Q96D15 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCN3Q96D15 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RCN3Q96D15 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCN3Q96D15 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCN3Q96D15 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCN3Q96D15 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RCN3Q96D15 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RCN3Q96D15 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RCN3Q96D15 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RCN3Q96D15 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RCN3Q96D15 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RCN3Q96D15 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RCN3Q96D15 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RCN3Q96D15 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms