Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC74AQ96AQ1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC74AQ96AQ1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC74AQ96AQ1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC74AQ96AQ1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC74AQ96AQ1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC74AQ96AQ1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC74AQ96AQ1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC74AQ96AQ1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC74AQ96AQ1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC74AQ96AQ1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC74AQ96AQ1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC74AQ96AQ1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC74AQ96AQ1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC74AQ96AQ1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC74AQ96AQ1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC74AQ96AQ1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC74AQ96AQ1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC74AQ96AQ1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC74AQ96AQ1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC74AQ96AQ1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC74AQ96AQ1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC74AQ96AQ1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC74AQ96AQ1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC74AQ96AQ1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC74AQ96AQ1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC74AQ96AQ1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC74AQ96AQ1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC74AQ96AQ1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC74AQ96AQ1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC74AQ96AQ1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC74AQ96AQ1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC74AQ96AQ1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC74AQ96AQ1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC74AQ96AQ1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC74AQ96AQ1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC74AQ96AQ1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC74AQ96AQ1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC74AQ96AQ1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC74AQ96AQ1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC74AQ96AQ1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC74AQ96AQ1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC74AQ96AQ1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC74AQ96AQ1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC74AQ96AQ1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC74AQ96AQ1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC74AQ96AQ1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC74AQ96AQ1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC74AQ96AQ1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC74AQ96AQ1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC74AQ96AQ1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC74AQ96AQ1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC74AQ96AQ1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC74AQ96AQ1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC74AQ96AQ1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC74AQ96AQ1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC74AQ96AQ1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC74AQ96AQ1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC74AQ96AQ1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC74AQ96AQ1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC74AQ96AQ1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC74AQ96AQ1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC74AQ96AQ1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC74AQ96AQ1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC74AQ96AQ1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC74AQ96AQ1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC74AQ96AQ1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC74AQ96AQ1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC74AQ96AQ1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC74AQ96AQ1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC74AQ96AQ1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC74AQ96AQ1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC74AQ96AQ1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC74AQ96AQ1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC74AQ96AQ1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC74AQ96AQ1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC74AQ96AQ1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC74AQ96AQ1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC74AQ96AQ1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC74AQ96AQ1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC74AQ96AQ1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC74AQ96AQ1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC74AQ96AQ1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC74AQ96AQ1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC74AQ96AQ1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC74AQ96AQ1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC74AQ96AQ1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC74AQ96AQ1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC74AQ96AQ1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC74AQ96AQ1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC74AQ96AQ1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC74AQ96AQ1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC74AQ96AQ1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC74AQ96AQ1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC74AQ96AQ1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC74AQ96AQ1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC74AQ96AQ1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC74AQ96AQ1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC74AQ96AQ1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC74AQ96AQ1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
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