Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y2

GTPBP3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP3Q969Y2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTPBP3Q969Y2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTPBP3Q969Y2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTPBP3Q969Y2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTPBP3Q969Y2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTPBP3Q969Y2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTPBP3Q969Y2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTPBP3Q969Y2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTPBP3Q969Y2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTPBP3Q969Y2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTPBP3Q969Y2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTPBP3Q969Y2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTPBP3Q969Y2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GTPBP3Q969Y2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTPBP3Q969Y2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTPBP3Q969Y2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTPBP3Q969Y2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTPBP3Q969Y2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTPBP3Q969Y2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTPBP3Q969Y2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTPBP3Q969Y2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTPBP3Q969Y2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTPBP3Q969Y2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTPBP3Q969Y2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GTPBP3Q969Y2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GTPBP3Q969Y2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTPBP3Q969Y2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTPBP3Q969Y2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTPBP3Q969Y2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTPBP3Q969Y2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTPBP3Q969Y2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTPBP3Q969Y2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTPBP3Q969Y2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTPBP3Q969Y2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTPBP3Q969Y2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTPBP3Q969Y2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTPBP3Q969Y2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTPBP3Q969Y2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTPBP3Q969Y2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTPBP3Q969Y2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTPBP3Q969Y2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTPBP3Q969Y2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTPBP3Q969Y2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTPBP3Q969Y2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTPBP3Q969Y2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTPBP3Q969Y2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTPBP3Q969Y2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTPBP3Q969Y2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTPBP3Q969Y2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTPBP3Q969Y2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTPBP3Q969Y2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTPBP3Q969Y2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GTPBP3Q969Y2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTPBP3Q969Y2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTPBP3Q969Y2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTPBP3Q969Y2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTPBP3Q969Y2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GTPBP3Q969Y2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTPBP3Q969Y2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTPBP3Q969Y2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTPBP3Q969Y2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTPBP3Q969Y2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTPBP3Q969Y2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTPBP3Q969Y2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTPBP3Q969Y2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTPBP3Q969Y2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTPBP3Q969Y2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTPBP3Q969Y2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTPBP3Q969Y2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTPBP3Q969Y2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTPBP3Q969Y2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTPBP3Q969Y2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTPBP3Q969Y2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTPBP3Q969Y2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTPBP3Q969Y2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTPBP3Q969Y2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTPBP3Q969Y2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTPBP3Q969Y2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTPBP3Q969Y2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTPBP3Q969Y2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTPBP3Q969Y2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTPBP3Q969Y2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTPBP3Q969Y2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTPBP3Q969Y2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTPBP3Q969Y2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTPBP3Q969Y2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTPBP3Q969Y2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTPBP3Q969Y2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTPBP3Q969Y2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GTPBP3Q969Y2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTPBP3Q969Y2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTPBP3Q969Y2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTPBP3Q969Y2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTPBP3Q969Y2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTPBP3Q969Y2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTPBP3Q969Y2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTPBP3Q969Y2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTPBP3Q969Y2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GTPBP3Q969Y2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTPBP3Q969Y2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms