Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GATA6Q92908 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GATA6Q92908 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GATA6Q92908 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GATA6Q92908 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GATA6Q92908 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GATA6Q92908 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GATA6Q92908 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GATA6Q92908 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GATA6Q92908 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GATA6Q92908 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GATA6Q92908 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GATA6Q92908 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GATA6Q92908 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GATA6Q92908 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GATA6Q92908 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GATA6Q92908 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GATA6Q92908 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GATA6Q92908 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GATA6Q92908 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GATA6Q92908 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GATA6Q92908 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GATA6Q92908 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GATA6Q92908 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GATA6Q92908 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GATA6Q92908 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GATA6Q92908 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GATA6Q92908 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GATA6Q92908 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GATA6Q92908 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GATA6Q92908 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GATA6Q92908 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GATA6Q92908 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GATA6Q92908 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GATA6Q92908 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GATA6Q92908 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GATA6Q92908 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GATA6Q92908 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GATA6Q92908 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GATA6Q92908 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
GATA6Q92908 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GATA6Q92908 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GATA6Q92908 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GATA6Q92908 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GATA6Q92908 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GATA6Q92908 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GATA6Q92908 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GATA6Q92908 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GATA6Q92908 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GATA6Q92908 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GATA6Q92908 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GATA6Q92908 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GATA6Q92908 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GATA6Q92908 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GATA6Q92908 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GATA6Q92908 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GATA6Q92908 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GATA6Q92908 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GATA6Q92908 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GATA6Q92908 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GATA6Q92908 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GATA6Q92908 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GATA6Q92908 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GATA6Q92908 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GATA6Q92908 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GATA6Q92908 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GATA6Q92908 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GATA6Q92908 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GATA6Q92908 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GATA6Q92908 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GATA6Q92908 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GATA6Q92908 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GATA6Q92908 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GATA6Q92908 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GATA6Q92908 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GATA6Q92908 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GATA6Q92908 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GATA6Q92908 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GATA6Q92908 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GATA6Q92908 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GATA6Q92908 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GATA6Q92908 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GATA6Q92908 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GATA6Q92908 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GATA6Q92908 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GATA6Q92908 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GATA6Q92908 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GATA6Q92908 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GATA6Q92908 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GATA6Q92908 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GATA6Q92908 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GATA6Q92908 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GATA6Q92908 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GATA6Q92908 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GATA6Q92908 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GATA6Q92908 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GATA6Q92908 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GATA6Q92908 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GATA6Q92908 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GATA6Q92908 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms