Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTRA1Q92743 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTRA1Q92743 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HTRA1Q92743 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HTRA1Q92743 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HTRA1Q92743 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HTRA1Q92743 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HTRA1Q92743 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTRA1Q92743 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTRA1Q92743 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTRA1Q92743 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTRA1Q92743 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTRA1Q92743 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTRA1Q92743 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTRA1Q92743 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTRA1Q92743 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTRA1Q92743 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HTRA1Q92743 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTRA1Q92743 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTRA1Q92743 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTRA1Q92743 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTRA1Q92743 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTRA1Q92743 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTRA1Q92743 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HTRA1Q92743 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTRA1Q92743 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTRA1Q92743 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTRA1Q92743 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTRA1Q92743 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTRA1Q92743 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTRA1Q92743 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTRA1Q92743 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTRA1Q92743 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTRA1Q92743 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTRA1Q92743 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HTRA1Q92743 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTRA1Q92743 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTRA1Q92743 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTRA1Q92743 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTRA1Q92743 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTRA1Q92743 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTRA1Q92743 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HTRA1Q92743 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HTRA1Q92743 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTRA1Q92743 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTRA1Q92743 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTRA1Q92743 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTRA1Q92743 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTRA1Q92743 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTRA1Q92743 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTRA1Q92743 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTRA1Q92743 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTRA1Q92743 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTRA1Q92743 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTRA1Q92743 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTRA1Q92743 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTRA1Q92743 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTRA1Q92743 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HTRA1Q92743 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTRA1Q92743 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTRA1Q92743 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTRA1Q92743 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTRA1Q92743 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTRA1Q92743 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTRA1Q92743 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTRA1Q92743 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTRA1Q92743 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTRA1Q92743 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTRA1Q92743 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTRA1Q92743 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HTRA1Q92743 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTRA1Q92743 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTRA1Q92743 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTRA1Q92743 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTRA1Q92743 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTRA1Q92743 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HTRA1Q92743 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HTRA1Q92743 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTRA1Q92743 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HTRA1Q92743 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HTRA1Q92743 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HTRA1Q92743 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HTRA1Q92743 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HTRA1Q92743 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTRA1Q92743 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HTRA1Q92743 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTRA1Q92743 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTRA1Q92743 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HTRA1Q92743 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HTRA1Q92743 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HTRA1Q92743 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTRA1Q92743 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTRA1Q92743 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTRA1Q92743 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HTRA1Q92743 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTRA1Q92743 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HTRA1Q92743 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HTRA1Q92743 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HTRA1Q92743 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HTRA1Q92743 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms