Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RABGGTAQ92696 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RABGGTAQ92696 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RABGGTAQ92696 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RABGGTAQ92696 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
RABGGTAQ92696 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RABGGTAQ92696 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RABGGTAQ92696 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RABGGTAQ92696 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RABGGTAQ92696 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RABGGTAQ92696 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RABGGTAQ92696 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RABGGTAQ92696 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RABGGTAQ92696 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
RABGGTAQ92696 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RABGGTAQ92696 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RABGGTAQ92696 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RABGGTAQ92696 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RABGGTAQ92696 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RABGGTAQ92696 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RABGGTAQ92696 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RABGGTAQ92696 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RABGGTAQ92696 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RABGGTAQ92696 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RABGGTAQ92696 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RABGGTAQ92696 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RABGGTAQ92696 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RABGGTAQ92696 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RABGGTAQ92696 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
RABGGTAQ92696 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RABGGTAQ92696 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RABGGTAQ92696 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RABGGTAQ92696 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RABGGTAQ92696 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RABGGTAQ92696 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RABGGTAQ92696 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RABGGTAQ92696 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RABGGTAQ92696 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
RABGGTAQ92696 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
RABGGTAQ92696 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RABGGTAQ92696 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RABGGTAQ92696 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RABGGTAQ92696 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RABGGTAQ92696 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RABGGTAQ92696 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RABGGTAQ92696 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RABGGTAQ92696 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RABGGTAQ92696 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
RABGGTAQ92696 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RABGGTAQ92696 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RABGGTAQ92696 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RABGGTAQ92696 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RABGGTAQ92696 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RABGGTAQ92696 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RABGGTAQ92696 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RABGGTAQ92696 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RABGGTAQ92696 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RABGGTAQ92696 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RABGGTAQ92696 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RABGGTAQ92696 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RABGGTAQ92696 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RABGGTAQ92696 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RABGGTAQ92696 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RABGGTAQ92696 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RABGGTAQ92696 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RABGGTAQ92696 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RABGGTAQ92696 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RABGGTAQ92696 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RABGGTAQ92696 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RABGGTAQ92696 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RABGGTAQ92696 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RABGGTAQ92696 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RABGGTAQ92696 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RABGGTAQ92696 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RABGGTAQ92696 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RABGGTAQ92696 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RABGGTAQ92696 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RABGGTAQ92696 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RABGGTAQ92696 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RABGGTAQ92696 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
RABGGTAQ92696 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RABGGTAQ92696 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RABGGTAQ92696 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RABGGTAQ92696 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RABGGTAQ92696 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RABGGTAQ92696 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RABGGTAQ92696 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RABGGTAQ92696 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RABGGTAQ92696 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RABGGTAQ92696 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RABGGTAQ92696 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RABGGTAQ92696 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RABGGTAQ92696 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RABGGTAQ92696 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RABGGTAQ92696 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RABGGTAQ92696 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
RABGGTAQ92696 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RABGGTAQ92696 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RABGGTAQ92696 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RABGGTAQ92696 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms