Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ubxn1Q922Y1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ubxn1Q922Y1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubxn1Q922Y1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ubxn1Q922Y1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ubxn1Q922Y1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ubxn1Q922Y1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubxn1Q922Y1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubxn1Q922Y1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ubxn1Q922Y1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ubxn1Q922Y1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ubxn1Q922Y1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ubxn1Q922Y1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ubxn1Q922Y1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ubxn1Q922Y1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ubxn1Q922Y1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ubxn1Q922Y1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ubxn1Q922Y1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ubxn1Q922Y1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ubxn1Q922Y1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ubxn1Q922Y1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ubxn1Q922Y1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ubxn1Q922Y1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ubxn1Q922Y1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ubxn1Q922Y1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ubxn1Q922Y1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ubxn1Q922Y1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ubxn1Q922Y1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ubxn1Q922Y1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ubxn1Q922Y1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ubxn1Q922Y1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ubxn1Q922Y1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ubxn1Q922Y1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ubxn1Q922Y1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ubxn1Q922Y1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ubxn1Q922Y1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ubxn1Q922Y1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ubxn1Q922Y1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ubxn1Q922Y1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ubxn1Q922Y1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ubxn1Q922Y1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ubxn1Q922Y1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ubxn1Q922Y1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ubxn1Q922Y1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ubxn1Q922Y1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ubxn1Q922Y1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ubxn1Q922Y1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ubxn1Q922Y1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ubxn1Q922Y1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ubxn1Q922Y1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ubxn1Q922Y1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ubxn1Q922Y1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ubxn1Q922Y1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ubxn1Q922Y1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ubxn1Q922Y1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubxn1Q922Y1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ubxn1Q922Y1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ubxn1Q922Y1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ubxn1Q922Y1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ubxn1Q922Y1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubxn1Q922Y1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubxn1Q922Y1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubxn1Q922Y1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubxn1Q922Y1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ubxn1Q922Y1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ubxn1Q922Y1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ubxn1Q922Y1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ubxn1Q922Y1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ubxn1Q922Y1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ubxn1Q922Y1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ubxn1Q922Y1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ubxn1Q922Y1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ubxn1Q922Y1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ubxn1Q922Y1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ubxn1Q922Y1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ubxn1Q922Y1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ubxn1Q922Y1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ubxn1Q922Y1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ubxn1Q922Y1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ubxn1Q922Y1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ubxn1Q922Y1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ubxn1Q922Y1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ubxn1Q922Y1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ubxn1Q922Y1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ubxn1Q922Y1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ubxn1Q922Y1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ubxn1Q922Y1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ubxn1Q922Y1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ubxn1Q922Y1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ubxn1Q922Y1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubxn1Q922Y1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubxn1Q922Y1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ubxn1Q922Y1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubxn1Q922Y1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ubxn1Q922Y1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ubxn1Q922Y1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ubxn1Q922Y1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ubxn1Q922Y1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ubxn1Q922Y1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ubxn1Q922Y1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms