Protein–RNA interactions for Protein: Q920V1

B3galnt1, UDP-GalNAc:beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3galnt1Q920V1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
B3galnt1Q920V1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B3galnt1Q920V1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B3galnt1Q920V1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B3galnt1Q920V1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B3galnt1Q920V1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B3galnt1Q920V1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
B3galnt1Q920V1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B3galnt1Q920V1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B3galnt1Q920V1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
B3galnt1Q920V1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
B3galnt1Q920V1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
B3galnt1Q920V1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
B3galnt1Q920V1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
B3galnt1Q920V1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
B3galnt1Q920V1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
B3galnt1Q920V1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
B3galnt1Q920V1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
B3galnt1Q920V1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
B3galnt1Q920V1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
B3galnt1Q920V1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
B3galnt1Q920V1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
B3galnt1Q920V1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
B3galnt1Q920V1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
B3galnt1Q920V1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
B3galnt1Q920V1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
B3galnt1Q920V1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
B3galnt1Q920V1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
B3galnt1Q920V1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
B3galnt1Q920V1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
B3galnt1Q920V1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
B3galnt1Q920V1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
B3galnt1Q920V1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
B3galnt1Q920V1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
B3galnt1Q920V1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
B3galnt1Q920V1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
B3galnt1Q920V1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
B3galnt1Q920V1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B3galnt1Q920V1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B3galnt1Q920V1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B3galnt1Q920V1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
B3galnt1Q920V1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
B3galnt1Q920V1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
B3galnt1Q920V1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
B3galnt1Q920V1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
B3galnt1Q920V1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
B3galnt1Q920V1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
B3galnt1Q920V1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
B3galnt1Q920V1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
B3galnt1Q920V1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
B3galnt1Q920V1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B3galnt1Q920V1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
B3galnt1Q920V1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
B3galnt1Q920V1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
B3galnt1Q920V1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
B3galnt1Q920V1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
B3galnt1Q920V1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
B3galnt1Q920V1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
B3galnt1Q920V1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
B3galnt1Q920V1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
B3galnt1Q920V1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B3galnt1Q920V1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
B3galnt1Q920V1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
B3galnt1Q920V1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
B3galnt1Q920V1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
B3galnt1Q920V1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
B3galnt1Q920V1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
B3galnt1Q920V1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
B3galnt1Q920V1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
B3galnt1Q920V1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
B3galnt1Q920V1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
B3galnt1Q920V1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
B3galnt1Q920V1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B3galnt1Q920V1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B3galnt1Q920V1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B3galnt1Q920V1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
B3galnt1Q920V1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B3galnt1Q920V1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B3galnt1Q920V1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B3galnt1Q920V1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B3galnt1Q920V1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B3galnt1Q920V1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B3galnt1Q920V1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
B3galnt1Q920V1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B3galnt1Q920V1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
B3galnt1Q920V1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
B3galnt1Q920V1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
B3galnt1Q920V1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
B3galnt1Q920V1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
B3galnt1Q920V1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
B3galnt1Q920V1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B3galnt1Q920V1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
B3galnt1Q920V1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B3galnt1Q920V1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
B3galnt1Q920V1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
B3galnt1Q920V1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
B3galnt1Q920V1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
B3galnt1Q920V1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
B3galnt1Q920V1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B3galnt1Q920V1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.1 ms