Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZM2

Sh2b1, SH2B adapter protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2b1Q91ZM2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Sh2b1Q91ZM2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sh2b1Q91ZM2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sh2b1Q91ZM2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sh2b1Q91ZM2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Sh2b1Q91ZM2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sh2b1Q91ZM2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sh2b1Q91ZM2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sh2b1Q91ZM2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sh2b1Q91ZM2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sh2b1Q91ZM2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Sh2b1Q91ZM2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sh2b1Q91ZM2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sh2b1Q91ZM2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sh2b1Q91ZM2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sh2b1Q91ZM2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sh2b1Q91ZM2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sh2b1Q91ZM2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sh2b1Q91ZM2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sh2b1Q91ZM2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sh2b1Q91ZM2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Sh2b1Q91ZM2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sh2b1Q91ZM2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sh2b1Q91ZM2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sh2b1Q91ZM2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sh2b1Q91ZM2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Sh2b1Q91ZM2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sh2b1Q91ZM2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sh2b1Q91ZM2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sh2b1Q91ZM2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sh2b1Q91ZM2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sh2b1Q91ZM2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sh2b1Q91ZM2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sh2b1Q91ZM2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sh2b1Q91ZM2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sh2b1Q91ZM2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sh2b1Q91ZM2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sh2b1Q91ZM2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sh2b1Q91ZM2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sh2b1Q91ZM2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Sh2b1Q91ZM2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sh2b1Q91ZM2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sh2b1Q91ZM2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sh2b1Q91ZM2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sh2b1Q91ZM2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sh2b1Q91ZM2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sh2b1Q91ZM2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sh2b1Q91ZM2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sh2b1Q91ZM2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sh2b1Q91ZM2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sh2b1Q91ZM2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sh2b1Q91ZM2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sh2b1Q91ZM2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Sh2b1Q91ZM2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Sh2b1Q91ZM2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sh2b1Q91ZM2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sh2b1Q91ZM2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Sh2b1Q91ZM2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sh2b1Q91ZM2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sh2b1Q91ZM2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sh2b1Q91ZM2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sh2b1Q91ZM2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Sh2b1Q91ZM2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Sh2b1Q91ZM2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sh2b1Q91ZM2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Sh2b1Q91ZM2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sh2b1Q91ZM2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sh2b1Q91ZM2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sh2b1Q91ZM2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sh2b1Q91ZM2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sh2b1Q91ZM2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sh2b1Q91ZM2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Sh2b1Q91ZM2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sh2b1Q91ZM2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sh2b1Q91ZM2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sh2b1Q91ZM2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sh2b1Q91ZM2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sh2b1Q91ZM2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sh2b1Q91ZM2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sh2b1Q91ZM2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sh2b1Q91ZM2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sh2b1Q91ZM2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Sh2b1Q91ZM2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sh2b1Q91ZM2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sh2b1Q91ZM2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Sh2b1Q91ZM2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sh2b1Q91ZM2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sh2b1Q91ZM2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sh2b1Q91ZM2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Sh2b1Q91ZM2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Sh2b1Q91ZM2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Sh2b1Q91ZM2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sh2b1Q91ZM2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sh2b1Q91ZM2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sh2b1Q91ZM2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sh2b1Q91ZM2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Sh2b1Q91ZM2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sh2b1Q91ZM2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sh2b1Q91ZM2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sh2b1Q91ZM2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms