Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx4Q91YJ2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx4Q91YJ2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx4Q91YJ2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx4Q91YJ2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx4Q91YJ2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx4Q91YJ2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx4Q91YJ2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx4Q91YJ2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx4Q91YJ2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx4Q91YJ2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx4Q91YJ2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx4Q91YJ2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx4Q91YJ2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx4Q91YJ2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx4Q91YJ2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx4Q91YJ2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx4Q91YJ2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx4Q91YJ2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx4Q91YJ2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx4Q91YJ2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx4Q91YJ2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx4Q91YJ2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx4Q91YJ2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx4Q91YJ2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx4Q91YJ2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx4Q91YJ2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx4Q91YJ2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx4Q91YJ2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx4Q91YJ2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx4Q91YJ2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx4Q91YJ2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx4Q91YJ2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx4Q91YJ2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx4Q91YJ2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx4Q91YJ2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx4Q91YJ2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx4Q91YJ2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Snx4Q91YJ2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx4Q91YJ2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx4Q91YJ2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx4Q91YJ2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx4Q91YJ2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx4Q91YJ2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx4Q91YJ2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snx4Q91YJ2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snx4Q91YJ2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snx4Q91YJ2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx4Q91YJ2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx4Q91YJ2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx4Q91YJ2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx4Q91YJ2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx4Q91YJ2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx4Q91YJ2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx4Q91YJ2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx4Q91YJ2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx4Q91YJ2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx4Q91YJ2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx4Q91YJ2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx4Q91YJ2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Snx4Q91YJ2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Snx4Q91YJ2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx4Q91YJ2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx4Q91YJ2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx4Q91YJ2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx4Q91YJ2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx4Q91YJ2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx4Q91YJ2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx4Q91YJ2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx4Q91YJ2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx4Q91YJ2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx4Q91YJ2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx4Q91YJ2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx4Q91YJ2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx4Q91YJ2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx4Q91YJ2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx4Q91YJ2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx4Q91YJ2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx4Q91YJ2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx4Q91YJ2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx4Q91YJ2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx4Q91YJ2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx4Q91YJ2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx4Q91YJ2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx4Q91YJ2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx4Q91YJ2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx4Q91YJ2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx4Q91YJ2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx4Q91YJ2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx4Q91YJ2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx4Q91YJ2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snx4Q91YJ2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snx4Q91YJ2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx4Q91YJ2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx4Q91YJ2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx4Q91YJ2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx4Q91YJ2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx4Q91YJ2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx4Q91YJ2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx4Q91YJ2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms