Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Chrna2Q91X60 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Chrna2Q91X60 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Chrna2Q91X60 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Chrna2Q91X60 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Chrna2Q91X60 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Chrna2Q91X60 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Chrna2Q91X60 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Chrna2Q91X60 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Chrna2Q91X60 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Chrna2Q91X60 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Chrna2Q91X60 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Chrna2Q91X60 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Chrna2Q91X60 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Chrna2Q91X60 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Chrna2Q91X60 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Chrna2Q91X60 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Chrna2Q91X60 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Chrna2Q91X60 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Chrna2Q91X60 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Chrna2Q91X60 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Chrna2Q91X60 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Chrna2Q91X60 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Chrna2Q91X60 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Chrna2Q91X60 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Chrna2Q91X60 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Chrna2Q91X60 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Chrna2Q91X60 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Chrna2Q91X60 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Chrna2Q91X60 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Chrna2Q91X60 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Chrna2Q91X60 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Chrna2Q91X60 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Chrna2Q91X60 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Chrna2Q91X60 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Chrna2Q91X60 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Chrna2Q91X60 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Chrna2Q91X60 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Chrna2Q91X60 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Chrna2Q91X60 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Chrna2Q91X60 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Chrna2Q91X60 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Chrna2Q91X60 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Chrna2Q91X60 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Chrna2Q91X60 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Chrna2Q91X60 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Chrna2Q91X60 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Chrna2Q91X60 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Chrna2Q91X60 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Chrna2Q91X60 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Chrna2Q91X60 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Chrna2Q91X60 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Chrna2Q91X60 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Chrna2Q91X60 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Chrna2Q91X60 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Chrna2Q91X60 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Chrna2Q91X60 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Chrna2Q91X60 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Chrna2Q91X60 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Chrna2Q91X60 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Chrna2Q91X60 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Chrna2Q91X60 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Chrna2Q91X60 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Chrna2Q91X60 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Chrna2Q91X60 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Chrna2Q91X60 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Chrna2Q91X60 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Chrna2Q91X60 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Chrna2Q91X60 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Chrna2Q91X60 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Chrna2Q91X60 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Chrna2Q91X60 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Chrna2Q91X60 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Chrna2Q91X60 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Chrna2Q91X60 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Chrna2Q91X60 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Chrna2Q91X60 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Chrna2Q91X60 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Chrna2Q91X60 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Chrna2Q91X60 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Chrna2Q91X60 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Chrna2Q91X60 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Chrna2Q91X60 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Chrna2Q91X60 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Chrna2Q91X60 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Chrna2Q91X60 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Chrna2Q91X60 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Chrna2Q91X60 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
Chrna2Q91X60 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Chrna2Q91X60 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Chrna2Q91X60 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Chrna2Q91X60 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Chrna2Q91X60 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Chrna2Q91X60 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Chrna2Q91X60 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Chrna2Q91X60 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Chrna2Q91X60 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Chrna2Q91X60 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Chrna2Q91X60 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Chrna2Q91X60 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms