Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hdac11Q91WA3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Hdac11Q91WA3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hdac11Q91WA3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hdac11Q91WA3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hdac11Q91WA3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hdac11Q91WA3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hdac11Q91WA3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdac11Q91WA3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdac11Q91WA3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hdac11Q91WA3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hdac11Q91WA3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hdac11Q91WA3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac11Q91WA3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac11Q91WA3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac11Q91WA3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac11Q91WA3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac11Q91WA3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdac11Q91WA3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdac11Q91WA3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac11Q91WA3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac11Q91WA3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac11Q91WA3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac11Q91WA3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac11Q91WA3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hdac11Q91WA3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hdac11Q91WA3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac11Q91WA3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac11Q91WA3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac11Q91WA3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac11Q91WA3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdac11Q91WA3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hdac11Q91WA3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdac11Q91WA3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hdac11Q91WA3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac11Q91WA3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hdac11Q91WA3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hdac11Q91WA3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac11Q91WA3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hdac11Q91WA3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac11Q91WA3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hdac11Q91WA3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hdac11Q91WA3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hdac11Q91WA3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Hdac11Q91WA3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac11Q91WA3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac11Q91WA3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hdac11Q91WA3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hdac11Q91WA3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdac11Q91WA3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hdac11Q91WA3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hdac11Q91WA3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac11Q91WA3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac11Q91WA3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hdac11Q91WA3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac11Q91WA3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hdac11Q91WA3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac11Q91WA3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac11Q91WA3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac11Q91WA3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac11Q91WA3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac11Q91WA3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac11Q91WA3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac11Q91WA3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac11Q91WA3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac11Q91WA3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac11Q91WA3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac11Q91WA3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hdac11Q91WA3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Hdac11Q91WA3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hdac11Q91WA3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac11Q91WA3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac11Q91WA3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hdac11Q91WA3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hdac11Q91WA3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdac11Q91WA3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hdac11Q91WA3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdac11Q91WA3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hdac11Q91WA3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac11Q91WA3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac11Q91WA3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Hdac11Q91WA3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hdac11Q91WA3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdac11Q91WA3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hdac11Q91WA3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac11Q91WA3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hdac11Q91WA3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hdac11Q91WA3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac11Q91WA3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac11Q91WA3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac11Q91WA3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hdac11Q91WA3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdac11Q91WA3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hdac11Q91WA3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hdac11Q91WA3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hdac11Q91WA3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hdac11Q91WA3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hdac11Q91WA3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hdac11Q91WA3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hdac11Q91WA3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms