Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC45.71■■■■■ 4.91
CTTNBP2Q8WZ74 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC45.71■■■■■ 4.91
CTTNBP2Q8WZ74 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC45.71■■■■■ 4.91
CTTNBP2Q8WZ74 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
CTTNBP2Q8WZ74 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
CTTNBP2Q8WZ74 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC45.67■■■■■ 4.9
CTTNBP2Q8WZ74 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.66■■■■■ 4.9
CTTNBP2Q8WZ74 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
CTTNBP2Q8WZ74 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC45.64■■■■■ 4.9
CTTNBP2Q8WZ74 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC45.63■■■■■ 4.9
CTTNBP2Q8WZ74 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
CTTNBP2Q8WZ74 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC45.53■■■■■ 4.88
CTTNBP2Q8WZ74 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC45.53■■■■■ 4.88
CTTNBP2Q8WZ74 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
CTTNBP2Q8WZ74 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.49■■■■■ 4.87
CTTNBP2Q8WZ74 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
CTTNBP2Q8WZ74 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC45.46■■■■■ 4.87
CTTNBP2Q8WZ74 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC45.46■■■■■ 4.87
CTTNBP2Q8WZ74 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.44■■■■■ 4.86
CTTNBP2Q8WZ74 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC45.43■■■■■ 4.86
CTTNBP2Q8WZ74 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
CTTNBP2Q8WZ74 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
CTTNBP2Q8WZ74 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
CTTNBP2Q8WZ74 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC45.36■■■■■ 4.85
CTTNBP2Q8WZ74 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
CTTNBP2Q8WZ74 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
CTTNBP2Q8WZ74 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
CTTNBP2Q8WZ74 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
CTTNBP2Q8WZ74 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC45.29■■■■■ 4.84
CTTNBP2Q8WZ74 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
CTTNBP2Q8WZ74 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
CTTNBP2Q8WZ74 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC45.27■■■■■ 4.84
CTTNBP2Q8WZ74 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
CTTNBP2Q8WZ74 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
CTTNBP2Q8WZ74 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC45.22■■■■■ 4.83
CTTNBP2Q8WZ74 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
CTTNBP2Q8WZ74 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC45.21■■■■■ 4.83
CTTNBP2Q8WZ74 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
CTTNBP2Q8WZ74 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
CTTNBP2Q8WZ74 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
CTTNBP2Q8WZ74 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.17■■■■■ 4.82
CTTNBP2Q8WZ74 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC45.17■■■■■ 4.82
CTTNBP2Q8WZ74 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.16■■■■■ 4.82
CTTNBP2Q8WZ74 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
CTTNBP2Q8WZ74 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC45.15■■■■■ 4.82
CTTNBP2Q8WZ74 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
CTTNBP2Q8WZ74 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.13■■■■■ 4.82
CTTNBP2Q8WZ74 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC45.13■■■■■ 4.82
CTTNBP2Q8WZ74 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
CTTNBP2Q8WZ74 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC45.12■■■■■ 4.81
CTTNBP2Q8WZ74 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC45.12■■■■■ 4.81
CTTNBP2Q8WZ74 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
CTTNBP2Q8WZ74 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
CTTNBP2Q8WZ74 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC45.08■■■■■ 4.81
CTTNBP2Q8WZ74 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC45.06■■■■■ 4.8
CTTNBP2Q8WZ74 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC45.05■■■■■ 4.8
CTTNBP2Q8WZ74 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
CTTNBP2Q8WZ74 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
CTTNBP2Q8WZ74 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC45.02■■■■■ 4.8
CTTNBP2Q8WZ74 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
CTTNBP2Q8WZ74 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC44.99■■■■■ 4.79
CTTNBP2Q8WZ74 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
CTTNBP2Q8WZ74 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC44.94■■■■■ 4.78
CTTNBP2Q8WZ74 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC44.94■■■■■ 4.78
CTTNBP2Q8WZ74 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
CTTNBP2Q8WZ74 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC44.91■■■■■ 4.78
CTTNBP2Q8WZ74 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
CTTNBP2Q8WZ74 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
CTTNBP2Q8WZ74 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC44.87■■■■■ 4.77
CTTNBP2Q8WZ74 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC44.86■■■■■ 4.77
CTTNBP2Q8WZ74 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC44.85■■■■■ 4.77
CTTNBP2Q8WZ74 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
CTTNBP2Q8WZ74 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
CTTNBP2Q8WZ74 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
CTTNBP2Q8WZ74 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC44.83■■■■■ 4.77
CTTNBP2Q8WZ74 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.83■■■■■ 4.77
CTTNBP2Q8WZ74 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC44.82■■■■■ 4.77
CTTNBP2Q8WZ74 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
CTTNBP2Q8WZ74 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
CTTNBP2Q8WZ74 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC44.77■■■■■ 4.76
CTTNBP2Q8WZ74 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.75
CTTNBP2Q8WZ74 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC44.7■■■■■ 4.75
CTTNBP2Q8WZ74 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
CTTNBP2Q8WZ74 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.67■■■■■ 4.74
CTTNBP2Q8WZ74 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
CTTNBP2Q8WZ74 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC44.64■■■■■ 4.74
CTTNBP2Q8WZ74 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.74
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.62■■■■■ 4.73
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.62■■■■■ 4.73
CTTNBP2Q8WZ74 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
CTTNBP2Q8WZ74 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
CTTNBP2Q8WZ74 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
CTTNBP2Q8WZ74 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC44.58■■■■■ 4.73
CTTNBP2Q8WZ74 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC44.58■■■■■ 4.73
CTTNBP2Q8WZ74 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
CTTNBP2Q8WZ74 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.57■■■■■ 4.73
CTTNBP2Q8WZ74 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.57■■■■■ 4.73
CTTNBP2Q8WZ74 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.72
CTTNBP2Q8WZ74 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC44.55■■■■■ 4.72
CTTNBP2Q8WZ74 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms