Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GATAD2BQ8WXI9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GATAD2BQ8WXI9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GATAD2BQ8WXI9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GATAD2BQ8WXI9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GATAD2BQ8WXI9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GATAD2BQ8WXI9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GATAD2BQ8WXI9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GATAD2BQ8WXI9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GATAD2BQ8WXI9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GATAD2BQ8WXI9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GATAD2BQ8WXI9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GATAD2BQ8WXI9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GATAD2BQ8WXI9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GATAD2BQ8WXI9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GATAD2BQ8WXI9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GATAD2BQ8WXI9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GATAD2BQ8WXI9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GATAD2BQ8WXI9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GATAD2BQ8WXI9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GATAD2BQ8WXI9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GATAD2BQ8WXI9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GATAD2BQ8WXI9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GATAD2BQ8WXI9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GATAD2BQ8WXI9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GATAD2BQ8WXI9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GATAD2BQ8WXI9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GATAD2BQ8WXI9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GATAD2BQ8WXI9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GATAD2BQ8WXI9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GATAD2BQ8WXI9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GATAD2BQ8WXI9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GATAD2BQ8WXI9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GATAD2BQ8WXI9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GATAD2BQ8WXI9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GATAD2BQ8WXI9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GATAD2BQ8WXI9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GATAD2BQ8WXI9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GATAD2BQ8WXI9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GATAD2BQ8WXI9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GATAD2BQ8WXI9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GATAD2BQ8WXI9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GATAD2BQ8WXI9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GATAD2BQ8WXI9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GATAD2BQ8WXI9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GATAD2BQ8WXI9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GATAD2BQ8WXI9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GATAD2BQ8WXI9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATAD2BQ8WXI9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATAD2BQ8WXI9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATAD2BQ8WXI9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GATAD2BQ8WXI9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GATAD2BQ8WXI9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GATAD2BQ8WXI9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GATAD2BQ8WXI9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GATAD2BQ8WXI9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GATAD2BQ8WXI9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GATAD2BQ8WXI9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GATAD2BQ8WXI9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GATAD2BQ8WXI9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GATAD2BQ8WXI9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GATAD2BQ8WXI9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GATAD2BQ8WXI9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GATAD2BQ8WXI9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GATAD2BQ8WXI9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GATAD2BQ8WXI9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GATAD2BQ8WXI9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GATAD2BQ8WXI9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GATAD2BQ8WXI9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GATAD2BQ8WXI9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GATAD2BQ8WXI9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GATAD2BQ8WXI9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GATAD2BQ8WXI9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GATAD2BQ8WXI9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GATAD2BQ8WXI9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GATAD2BQ8WXI9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GATAD2BQ8WXI9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GATAD2BQ8WXI9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GATAD2BQ8WXI9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GATAD2BQ8WXI9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GATAD2BQ8WXI9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GATAD2BQ8WXI9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GATAD2BQ8WXI9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GATAD2BQ8WXI9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GATAD2BQ8WXI9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GATAD2BQ8WXI9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GATAD2BQ8WXI9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GATAD2BQ8WXI9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GATAD2BQ8WXI9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GATAD2BQ8WXI9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GATAD2BQ8WXI9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GATAD2BQ8WXI9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GATAD2BQ8WXI9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GATAD2BQ8WXI9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GATAD2BQ8WXI9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GATAD2BQ8WXI9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GATAD2BQ8WXI9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GATAD2BQ8WXI9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GATAD2BQ8WXI9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GATAD2BQ8WXI9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms