Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATL1Q8WXF7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATL1Q8WXF7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATL1Q8WXF7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATL1Q8WXF7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATL1Q8WXF7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATL1Q8WXF7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATL1Q8WXF7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATL1Q8WXF7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATL1Q8WXF7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATL1Q8WXF7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATL1Q8WXF7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATL1Q8WXF7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATL1Q8WXF7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATL1Q8WXF7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATL1Q8WXF7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATL1Q8WXF7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATL1Q8WXF7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATL1Q8WXF7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATL1Q8WXF7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATL1Q8WXF7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATL1Q8WXF7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATL1Q8WXF7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATL1Q8WXF7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATL1Q8WXF7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATL1Q8WXF7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATL1Q8WXF7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATL1Q8WXF7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATL1Q8WXF7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATL1Q8WXF7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATL1Q8WXF7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATL1Q8WXF7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATL1Q8WXF7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATL1Q8WXF7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATL1Q8WXF7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATL1Q8WXF7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATL1Q8WXF7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATL1Q8WXF7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATL1Q8WXF7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATL1Q8WXF7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATL1Q8WXF7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATL1Q8WXF7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATL1Q8WXF7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATL1Q8WXF7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATL1Q8WXF7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATL1Q8WXF7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATL1Q8WXF7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATL1Q8WXF7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATL1Q8WXF7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATL1Q8WXF7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATL1Q8WXF7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATL1Q8WXF7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ATL1Q8WXF7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATL1Q8WXF7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATL1Q8WXF7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATL1Q8WXF7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATL1Q8WXF7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATL1Q8WXF7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATL1Q8WXF7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATL1Q8WXF7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATL1Q8WXF7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATL1Q8WXF7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATL1Q8WXF7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATL1Q8WXF7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATL1Q8WXF7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATL1Q8WXF7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATL1Q8WXF7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATL1Q8WXF7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATL1Q8WXF7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATL1Q8WXF7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATL1Q8WXF7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATL1Q8WXF7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATL1Q8WXF7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATL1Q8WXF7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATL1Q8WXF7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATL1Q8WXF7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATL1Q8WXF7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATL1Q8WXF7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATL1Q8WXF7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATL1Q8WXF7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATL1Q8WXF7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATL1Q8WXF7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATL1Q8WXF7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATL1Q8WXF7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATL1Q8WXF7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATL1Q8WXF7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATL1Q8WXF7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATL1Q8WXF7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATL1Q8WXF7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATL1Q8WXF7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATL1Q8WXF7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATL1Q8WXF7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATL1Q8WXF7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATL1Q8WXF7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ATL1Q8WXF7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATL1Q8WXF7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATL1Q8WXF7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATL1Q8WXF7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATL1Q8WXF7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATL1Q8WXF7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms