Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps4aQ8VEJ9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Vps4aQ8VEJ9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vps4aQ8VEJ9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps4aQ8VEJ9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vps4aQ8VEJ9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps4aQ8VEJ9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps4aQ8VEJ9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Vps4aQ8VEJ9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps4aQ8VEJ9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps4aQ8VEJ9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Vps4aQ8VEJ9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps4aQ8VEJ9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps4aQ8VEJ9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vps4aQ8VEJ9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Vps4aQ8VEJ9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps4aQ8VEJ9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Vps4aQ8VEJ9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Vps4aQ8VEJ9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps4aQ8VEJ9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps4aQ8VEJ9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps4aQ8VEJ9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Vps4aQ8VEJ9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Vps4aQ8VEJ9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Vps4aQ8VEJ9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps4aQ8VEJ9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps4aQ8VEJ9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Vps4aQ8VEJ9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps4aQ8VEJ9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps4aQ8VEJ9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vps4aQ8VEJ9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vps4aQ8VEJ9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps4aQ8VEJ9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vps4aQ8VEJ9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps4aQ8VEJ9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Vps4aQ8VEJ9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps4aQ8VEJ9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vps4aQ8VEJ9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Vps4aQ8VEJ9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps4aQ8VEJ9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vps4aQ8VEJ9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vps4aQ8VEJ9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vps4aQ8VEJ9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vps4aQ8VEJ9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps4aQ8VEJ9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vps4aQ8VEJ9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps4aQ8VEJ9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vps4aQ8VEJ9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vps4aQ8VEJ9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps4aQ8VEJ9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps4aQ8VEJ9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps4aQ8VEJ9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps4aQ8VEJ9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Vps4aQ8VEJ9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps4aQ8VEJ9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps4aQ8VEJ9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps4aQ8VEJ9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Vps4aQ8VEJ9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps4aQ8VEJ9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps4aQ8VEJ9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps4aQ8VEJ9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps4aQ8VEJ9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps4aQ8VEJ9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps4aQ8VEJ9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps4aQ8VEJ9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vps4aQ8VEJ9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps4aQ8VEJ9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps4aQ8VEJ9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps4aQ8VEJ9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps4aQ8VEJ9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps4aQ8VEJ9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps4aQ8VEJ9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps4aQ8VEJ9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps4aQ8VEJ9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps4aQ8VEJ9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps4aQ8VEJ9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps4aQ8VEJ9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps4aQ8VEJ9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps4aQ8VEJ9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps4aQ8VEJ9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps4aQ8VEJ9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps4aQ8VEJ9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps4aQ8VEJ9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps4aQ8VEJ9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps4aQ8VEJ9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps4aQ8VEJ9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps4aQ8VEJ9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps4aQ8VEJ9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps4aQ8VEJ9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps4aQ8VEJ9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps4aQ8VEJ9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps4aQ8VEJ9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps4aQ8VEJ9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps4aQ8VEJ9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps4aQ8VEJ9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps4aQ8VEJ9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps4aQ8VEJ9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps4aQ8VEJ9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps4aQ8VEJ9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 267.3 ms