Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV8

Mitd1, MIT domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mitd1Q8VDV8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mitd1Q8VDV8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mitd1Q8VDV8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mitd1Q8VDV8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mitd1Q8VDV8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mitd1Q8VDV8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mitd1Q8VDV8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mitd1Q8VDV8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mitd1Q8VDV8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mitd1Q8VDV8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mitd1Q8VDV8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mitd1Q8VDV8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mitd1Q8VDV8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mitd1Q8VDV8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mitd1Q8VDV8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mitd1Q8VDV8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mitd1Q8VDV8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mitd1Q8VDV8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mitd1Q8VDV8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mitd1Q8VDV8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Mitd1Q8VDV8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mitd1Q8VDV8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mitd1Q8VDV8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mitd1Q8VDV8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mitd1Q8VDV8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mitd1Q8VDV8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mitd1Q8VDV8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mitd1Q8VDV8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mitd1Q8VDV8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mitd1Q8VDV8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mitd1Q8VDV8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mitd1Q8VDV8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mitd1Q8VDV8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mitd1Q8VDV8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mitd1Q8VDV8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mitd1Q8VDV8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mitd1Q8VDV8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Mitd1Q8VDV8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mitd1Q8VDV8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mitd1Q8VDV8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mitd1Q8VDV8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mitd1Q8VDV8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mitd1Q8VDV8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mitd1Q8VDV8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mitd1Q8VDV8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Mitd1Q8VDV8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mitd1Q8VDV8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mitd1Q8VDV8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Mitd1Q8VDV8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mitd1Q8VDV8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mitd1Q8VDV8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mitd1Q8VDV8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mitd1Q8VDV8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mitd1Q8VDV8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mitd1Q8VDV8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mitd1Q8VDV8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mitd1Q8VDV8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mitd1Q8VDV8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mitd1Q8VDV8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mitd1Q8VDV8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mitd1Q8VDV8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mitd1Q8VDV8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Mitd1Q8VDV8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mitd1Q8VDV8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mitd1Q8VDV8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mitd1Q8VDV8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mitd1Q8VDV8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mitd1Q8VDV8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mitd1Q8VDV8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mitd1Q8VDV8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mitd1Q8VDV8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mitd1Q8VDV8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mitd1Q8VDV8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Mitd1Q8VDV8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Mitd1Q8VDV8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Mitd1Q8VDV8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mitd1Q8VDV8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mitd1Q8VDV8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mitd1Q8VDV8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mitd1Q8VDV8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Mitd1Q8VDV8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mitd1Q8VDV8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mitd1Q8VDV8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mitd1Q8VDV8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mitd1Q8VDV8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mitd1Q8VDV8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mitd1Q8VDV8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mitd1Q8VDV8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mitd1Q8VDV8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mitd1Q8VDV8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mitd1Q8VDV8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mitd1Q8VDV8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mitd1Q8VDV8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mitd1Q8VDV8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Mitd1Q8VDV8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mitd1Q8VDV8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mitd1Q8VDV8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mitd1Q8VDV8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mitd1Q8VDV8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mitd1Q8VDV8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms