Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ6

Sgsm3, Small G protein signaling modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgsm3Q8VCZ6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sgsm3Q8VCZ6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sgsm3Q8VCZ6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sgsm3Q8VCZ6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sgsm3Q8VCZ6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sgsm3Q8VCZ6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Sgsm3Q8VCZ6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sgsm3Q8VCZ6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sgsm3Q8VCZ6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sgsm3Q8VCZ6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sgsm3Q8VCZ6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sgsm3Q8VCZ6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sgsm3Q8VCZ6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sgsm3Q8VCZ6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sgsm3Q8VCZ6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sgsm3Q8VCZ6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sgsm3Q8VCZ6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sgsm3Q8VCZ6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sgsm3Q8VCZ6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sgsm3Q8VCZ6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sgsm3Q8VCZ6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sgsm3Q8VCZ6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sgsm3Q8VCZ6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Sgsm3Q8VCZ6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sgsm3Q8VCZ6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Sgsm3Q8VCZ6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sgsm3Q8VCZ6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sgsm3Q8VCZ6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sgsm3Q8VCZ6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sgsm3Q8VCZ6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sgsm3Q8VCZ6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sgsm3Q8VCZ6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sgsm3Q8VCZ6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sgsm3Q8VCZ6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sgsm3Q8VCZ6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Sgsm3Q8VCZ6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Sgsm3Q8VCZ6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sgsm3Q8VCZ6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sgsm3Q8VCZ6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sgsm3Q8VCZ6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sgsm3Q8VCZ6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Sgsm3Q8VCZ6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sgsm3Q8VCZ6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Sgsm3Q8VCZ6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sgsm3Q8VCZ6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Sgsm3Q8VCZ6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sgsm3Q8VCZ6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sgsm3Q8VCZ6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sgsm3Q8VCZ6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sgsm3Q8VCZ6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sgsm3Q8VCZ6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sgsm3Q8VCZ6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sgsm3Q8VCZ6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sgsm3Q8VCZ6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sgsm3Q8VCZ6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sgsm3Q8VCZ6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sgsm3Q8VCZ6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sgsm3Q8VCZ6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sgsm3Q8VCZ6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sgsm3Q8VCZ6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sgsm3Q8VCZ6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sgsm3Q8VCZ6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sgsm3Q8VCZ6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sgsm3Q8VCZ6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sgsm3Q8VCZ6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sgsm3Q8VCZ6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sgsm3Q8VCZ6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sgsm3Q8VCZ6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sgsm3Q8VCZ6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sgsm3Q8VCZ6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sgsm3Q8VCZ6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sgsm3Q8VCZ6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sgsm3Q8VCZ6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sgsm3Q8VCZ6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sgsm3Q8VCZ6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sgsm3Q8VCZ6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sgsm3Q8VCZ6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sgsm3Q8VCZ6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sgsm3Q8VCZ6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sgsm3Q8VCZ6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sgsm3Q8VCZ6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sgsm3Q8VCZ6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sgsm3Q8VCZ6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Sgsm3Q8VCZ6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sgsm3Q8VCZ6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sgsm3Q8VCZ6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sgsm3Q8VCZ6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sgsm3Q8VCZ6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sgsm3Q8VCZ6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sgsm3Q8VCZ6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sgsm3Q8VCZ6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sgsm3Q8VCZ6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sgsm3Q8VCZ6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sgsm3Q8VCZ6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sgsm3Q8VCZ6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sgsm3Q8VCZ6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sgsm3Q8VCZ6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sgsm3Q8VCZ6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sgsm3Q8VCZ6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sgsm3Q8VCZ6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms