Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCB1

Ndc1, Nucleoporin NDC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc1Q8VCB1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ndc1Q8VCB1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ndc1Q8VCB1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ndc1Q8VCB1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ndc1Q8VCB1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ndc1Q8VCB1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ndc1Q8VCB1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ndc1Q8VCB1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ndc1Q8VCB1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ndc1Q8VCB1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ndc1Q8VCB1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ndc1Q8VCB1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ndc1Q8VCB1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ndc1Q8VCB1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ndc1Q8VCB1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ndc1Q8VCB1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ndc1Q8VCB1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ndc1Q8VCB1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ndc1Q8VCB1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ndc1Q8VCB1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ndc1Q8VCB1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ndc1Q8VCB1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ndc1Q8VCB1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ndc1Q8VCB1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ndc1Q8VCB1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ndc1Q8VCB1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ndc1Q8VCB1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ndc1Q8VCB1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ndc1Q8VCB1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ndc1Q8VCB1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ndc1Q8VCB1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ndc1Q8VCB1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ndc1Q8VCB1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ndc1Q8VCB1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ndc1Q8VCB1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ndc1Q8VCB1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ndc1Q8VCB1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ndc1Q8VCB1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ndc1Q8VCB1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ndc1Q8VCB1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ndc1Q8VCB1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndc1Q8VCB1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ndc1Q8VCB1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ndc1Q8VCB1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ndc1Q8VCB1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ndc1Q8VCB1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndc1Q8VCB1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndc1Q8VCB1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ndc1Q8VCB1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ndc1Q8VCB1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ndc1Q8VCB1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ndc1Q8VCB1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ndc1Q8VCB1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndc1Q8VCB1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndc1Q8VCB1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndc1Q8VCB1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ndc1Q8VCB1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndc1Q8VCB1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndc1Q8VCB1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndc1Q8VCB1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndc1Q8VCB1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndc1Q8VCB1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndc1Q8VCB1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndc1Q8VCB1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ndc1Q8VCB1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndc1Q8VCB1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndc1Q8VCB1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndc1Q8VCB1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndc1Q8VCB1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ndc1Q8VCB1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndc1Q8VCB1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ndc1Q8VCB1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ndc1Q8VCB1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ndc1Q8VCB1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndc1Q8VCB1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndc1Q8VCB1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndc1Q8VCB1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndc1Q8VCB1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndc1Q8VCB1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndc1Q8VCB1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ndc1Q8VCB1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ndc1Q8VCB1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ndc1Q8VCB1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ndc1Q8VCB1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ndc1Q8VCB1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ndc1Q8VCB1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndc1Q8VCB1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndc1Q8VCB1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndc1Q8VCB1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndc1Q8VCB1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ndc1Q8VCB1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ndc1Q8VCB1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ndc1Q8VCB1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ndc1Q8VCB1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ndc1Q8VCB1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndc1Q8VCB1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ndc1Q8VCB1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ndc1Q8VCB1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ndc1Q8VCB1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ndc1Q8VCB1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms