Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEU7

RAPGEF6, Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

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Length 1,601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6Q8TEU7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC44.73■■■■■ 4.75
RAPGEF6Q8TEU7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
RAPGEF6Q8TEU7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC44.7■■■■■ 4.75
RAPGEF6Q8TEU7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
RAPGEF6Q8TEU7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
RAPGEF6Q8TEU7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
RAPGEF6Q8TEU7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
RAPGEF6Q8TEU7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC44.61■■■■■ 4.73
RAPGEF6Q8TEU7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
RAPGEF6Q8TEU7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
RAPGEF6Q8TEU7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
RAPGEF6Q8TEU7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
RAPGEF6Q8TEU7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC44.47■■■■■ 4.71
RAPGEF6Q8TEU7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC44.46■■■■■ 4.71
RAPGEF6Q8TEU7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
RAPGEF6Q8TEU7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.43■■■■■ 4.7
RAPGEF6Q8TEU7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
RAPGEF6Q8TEU7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.37■■■■■ 4.69
RAPGEF6Q8TEU7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC44.37■■■■■ 4.69
RAPGEF6Q8TEU7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC44.33■■■■■ 4.69
RAPGEF6Q8TEU7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.33■■■■■ 4.69
RAPGEF6Q8TEU7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
RAPGEF6Q8TEU7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC44.31■■■■■ 4.68
RAPGEF6Q8TEU7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC44.3■■■■■ 4.68
RAPGEF6Q8TEU7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC44.29■■■■■ 4.68
RAPGEF6Q8TEU7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
RAPGEF6Q8TEU7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
RAPGEF6Q8TEU7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.25■■■■■ 4.67
RAPGEF6Q8TEU7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
RAPGEF6Q8TEU7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC44.24■■■■■ 4.67
RAPGEF6Q8TEU7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC44.23■■■■■ 4.67
RAPGEF6Q8TEU7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC44.22■■■■■ 4.67
RAPGEF6Q8TEU7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
RAPGEF6Q8TEU7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
RAPGEF6Q8TEU7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC44.21■■■■■ 4.67
RAPGEF6Q8TEU7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
RAPGEF6Q8TEU7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
RAPGEF6Q8TEU7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC44.18■■■■■ 4.66
RAPGEF6Q8TEU7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
RAPGEF6Q8TEU7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC44.17■■■■■ 4.66
RAPGEF6Q8TEU7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
RAPGEF6Q8TEU7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
RAPGEF6Q8TEU7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
RAPGEF6Q8TEU7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
RAPGEF6Q8TEU7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
RAPGEF6Q8TEU7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
RAPGEF6Q8TEU7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
RAPGEF6Q8TEU7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.12■■■■■ 4.65
RAPGEF6Q8TEU7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
RAPGEF6Q8TEU7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
RAPGEF6Q8TEU7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC44.07■■■■■ 4.64
RAPGEF6Q8TEU7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
RAPGEF6Q8TEU7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
RAPGEF6Q8TEU7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
RAPGEF6Q8TEU7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC44.02■■■■■ 4.64
RAPGEF6Q8TEU7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
RAPGEF6Q8TEU7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
RAPGEF6Q8TEU7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC44■■■■■ 4.63
RAPGEF6Q8TEU7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
RAPGEF6Q8TEU7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC43.99■■■■■ 4.63
RAPGEF6Q8TEU7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
RAPGEF6Q8TEU7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC43.98■■■■■ 4.63
RAPGEF6Q8TEU7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
RAPGEF6Q8TEU7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC43.96■■■■■ 4.63
RAPGEF6Q8TEU7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC43.95■■■■■ 4.63
RAPGEF6Q8TEU7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
RAPGEF6Q8TEU7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC43.95■■■■■ 4.63
RAPGEF6Q8TEU7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
RAPGEF6Q8TEU7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
RAPGEF6Q8TEU7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC43.92■■■■■ 4.62
RAPGEF6Q8TEU7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
RAPGEF6Q8TEU7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC43.9■■■■■ 4.62
RAPGEF6Q8TEU7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
RAPGEF6Q8TEU7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
RAPGEF6Q8TEU7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC43.88■■■■■ 4.62
RAPGEF6Q8TEU7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
RAPGEF6Q8TEU7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.61
RAPGEF6Q8TEU7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC43.87■■■■■ 4.61
RAPGEF6Q8TEU7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.78■■■■■ 4.6
RAPGEF6Q8TEU7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
RAPGEF6Q8TEU7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.75■■■■■ 4.59
RAPGEF6Q8TEU7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.75■■■■■ 4.59
RAPGEF6Q8TEU7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC43.73■■■■■ 4.59
RAPGEF6Q8TEU7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC43.73■■■■■ 4.59
RAPGEF6Q8TEU7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC43.7■■■■■ 4.59
RAPGEF6Q8TEU7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC43.69■■■■■ 4.58
RAPGEF6Q8TEU7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
RAPGEF6Q8TEU7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC43.67■■■■■ 4.58
RAPGEF6Q8TEU7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.65■■■■■ 4.58
RAPGEF6Q8TEU7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC43.64■■■■■ 4.58
RAPGEF6Q8TEU7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC43.6■■■■■ 4.57
RAPGEF6Q8TEU7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
RAPGEF6Q8TEU7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC43.59■■■■■ 4.57
RAPGEF6Q8TEU7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.56■■■■■ 4.56
RAPGEF6Q8TEU7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
RAPGEF6Q8TEU7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
RAPGEF6Q8TEU7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
RAPGEF6Q8TEU7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC43.55■■■■■ 4.56
RAPGEF6Q8TEU7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC43.55■■■■■ 4.56
RAPGEF6Q8TEU7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC43.55■■■■■ 4.56
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