Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ1

CD300LF, CMRF35-like molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300LFQ8TDQ1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD300LFQ8TDQ1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD300LFQ8TDQ1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD300LFQ8TDQ1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD300LFQ8TDQ1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD300LFQ8TDQ1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD300LFQ8TDQ1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD300LFQ8TDQ1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD300LFQ8TDQ1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD300LFQ8TDQ1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD300LFQ8TDQ1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD300LFQ8TDQ1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD300LFQ8TDQ1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD300LFQ8TDQ1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD300LFQ8TDQ1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD300LFQ8TDQ1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD300LFQ8TDQ1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD300LFQ8TDQ1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD300LFQ8TDQ1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD300LFQ8TDQ1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD300LFQ8TDQ1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD300LFQ8TDQ1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD300LFQ8TDQ1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD300LFQ8TDQ1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD300LFQ8TDQ1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD300LFQ8TDQ1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD300LFQ8TDQ1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD300LFQ8TDQ1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD300LFQ8TDQ1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD300LFQ8TDQ1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD300LFQ8TDQ1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD300LFQ8TDQ1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD300LFQ8TDQ1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD300LFQ8TDQ1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CD300LFQ8TDQ1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD300LFQ8TDQ1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD300LFQ8TDQ1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD300LFQ8TDQ1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD300LFQ8TDQ1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD300LFQ8TDQ1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD300LFQ8TDQ1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD300LFQ8TDQ1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD300LFQ8TDQ1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD300LFQ8TDQ1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD300LFQ8TDQ1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD300LFQ8TDQ1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD300LFQ8TDQ1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD300LFQ8TDQ1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD300LFQ8TDQ1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD300LFQ8TDQ1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CD300LFQ8TDQ1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD300LFQ8TDQ1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD300LFQ8TDQ1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD300LFQ8TDQ1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD300LFQ8TDQ1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD300LFQ8TDQ1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD300LFQ8TDQ1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD300LFQ8TDQ1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD300LFQ8TDQ1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD300LFQ8TDQ1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD300LFQ8TDQ1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD300LFQ8TDQ1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD300LFQ8TDQ1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD300LFQ8TDQ1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD300LFQ8TDQ1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD300LFQ8TDQ1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD300LFQ8TDQ1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD300LFQ8TDQ1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD300LFQ8TDQ1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD300LFQ8TDQ1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD300LFQ8TDQ1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD300LFQ8TDQ1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD300LFQ8TDQ1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD300LFQ8TDQ1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD300LFQ8TDQ1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD300LFQ8TDQ1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD300LFQ8TDQ1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CD300LFQ8TDQ1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD300LFQ8TDQ1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD300LFQ8TDQ1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD300LFQ8TDQ1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD300LFQ8TDQ1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD300LFQ8TDQ1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD300LFQ8TDQ1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD300LFQ8TDQ1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD300LFQ8TDQ1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD300LFQ8TDQ1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD300LFQ8TDQ1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD300LFQ8TDQ1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD300LFQ8TDQ1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD300LFQ8TDQ1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CD300LFQ8TDQ1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD300LFQ8TDQ1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD300LFQ8TDQ1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD300LFQ8TDQ1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD300LFQ8TDQ1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD300LFQ8TDQ1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD300LFQ8TDQ1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD300LFQ8TDQ1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD300LFQ8TDQ1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms