Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCG2

PI4K2B, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2BQ8TCG2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PI4K2BQ8TCG2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PI4K2BQ8TCG2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PI4K2BQ8TCG2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PI4K2BQ8TCG2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PI4K2BQ8TCG2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PI4K2BQ8TCG2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PI4K2BQ8TCG2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PI4K2BQ8TCG2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PI4K2BQ8TCG2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PI4K2BQ8TCG2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PI4K2BQ8TCG2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PI4K2BQ8TCG2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PI4K2BQ8TCG2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PI4K2BQ8TCG2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PI4K2BQ8TCG2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PI4K2BQ8TCG2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PI4K2BQ8TCG2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PI4K2BQ8TCG2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PI4K2BQ8TCG2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PI4K2BQ8TCG2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PI4K2BQ8TCG2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PI4K2BQ8TCG2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PI4K2BQ8TCG2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PI4K2BQ8TCG2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PI4K2BQ8TCG2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PI4K2BQ8TCG2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
PI4K2BQ8TCG2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PI4K2BQ8TCG2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
PI4K2BQ8TCG2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PI4K2BQ8TCG2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
PI4K2BQ8TCG2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PI4K2BQ8TCG2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PI4K2BQ8TCG2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PI4K2BQ8TCG2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
PI4K2BQ8TCG2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PI4K2BQ8TCG2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PI4K2BQ8TCG2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PI4K2BQ8TCG2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PI4K2BQ8TCG2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PI4K2BQ8TCG2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PI4K2BQ8TCG2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PI4K2BQ8TCG2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PI4K2BQ8TCG2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PI4K2BQ8TCG2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PI4K2BQ8TCG2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PI4K2BQ8TCG2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PI4K2BQ8TCG2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PI4K2BQ8TCG2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PI4K2BQ8TCG2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PI4K2BQ8TCG2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PI4K2BQ8TCG2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
PI4K2BQ8TCG2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PI4K2BQ8TCG2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PI4K2BQ8TCG2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PI4K2BQ8TCG2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PI4K2BQ8TCG2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PI4K2BQ8TCG2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PI4K2BQ8TCG2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PI4K2BQ8TCG2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PI4K2BQ8TCG2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PI4K2BQ8TCG2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PI4K2BQ8TCG2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PI4K2BQ8TCG2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PI4K2BQ8TCG2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PI4K2BQ8TCG2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PI4K2BQ8TCG2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PI4K2BQ8TCG2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PI4K2BQ8TCG2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PI4K2BQ8TCG2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PI4K2BQ8TCG2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PI4K2BQ8TCG2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PI4K2BQ8TCG2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PI4K2BQ8TCG2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PI4K2BQ8TCG2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PI4K2BQ8TCG2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PI4K2BQ8TCG2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PI4K2BQ8TCG2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PI4K2BQ8TCG2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PI4K2BQ8TCG2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PI4K2BQ8TCG2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
PI4K2BQ8TCG2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PI4K2BQ8TCG2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
PI4K2BQ8TCG2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PI4K2BQ8TCG2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PI4K2BQ8TCG2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PI4K2BQ8TCG2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PI4K2BQ8TCG2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PI4K2BQ8TCG2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PI4K2BQ8TCG2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PI4K2BQ8TCG2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
PI4K2BQ8TCG2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
PI4K2BQ8TCG2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PI4K2BQ8TCG2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PI4K2BQ8TCG2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PI4K2BQ8TCG2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PI4K2BQ8TCG2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PI4K2BQ8TCG2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PI4K2BQ8TCG2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PI4K2BQ8TCG2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms