Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC99

FNDC8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC8Q8TC99 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNDC8Q8TC99 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FNDC8Q8TC99 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FNDC8Q8TC99 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FNDC8Q8TC99 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FNDC8Q8TC99 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FNDC8Q8TC99 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FNDC8Q8TC99 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FNDC8Q8TC99 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FNDC8Q8TC99 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FNDC8Q8TC99 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FNDC8Q8TC99 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FNDC8Q8TC99 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FNDC8Q8TC99 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FNDC8Q8TC99 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FNDC8Q8TC99 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FNDC8Q8TC99 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FNDC8Q8TC99 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FNDC8Q8TC99 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FNDC8Q8TC99 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FNDC8Q8TC99 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FNDC8Q8TC99 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FNDC8Q8TC99 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FNDC8Q8TC99 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FNDC8Q8TC99 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FNDC8Q8TC99 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FNDC8Q8TC99 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FNDC8Q8TC99 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FNDC8Q8TC99 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FNDC8Q8TC99 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC8Q8TC99 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FNDC8Q8TC99 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FNDC8Q8TC99 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FNDC8Q8TC99 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FNDC8Q8TC99 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FNDC8Q8TC99 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FNDC8Q8TC99 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FNDC8Q8TC99 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FNDC8Q8TC99 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FNDC8Q8TC99 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FNDC8Q8TC99 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FNDC8Q8TC99 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNDC8Q8TC99 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FNDC8Q8TC99 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNDC8Q8TC99 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FNDC8Q8TC99 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FNDC8Q8TC99 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FNDC8Q8TC99 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FNDC8Q8TC99 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FNDC8Q8TC99 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FNDC8Q8TC99 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FNDC8Q8TC99 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FNDC8Q8TC99 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FNDC8Q8TC99 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNDC8Q8TC99 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FNDC8Q8TC99 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC8Q8TC99 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC8Q8TC99 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC8Q8TC99 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FNDC8Q8TC99 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FNDC8Q8TC99 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FNDC8Q8TC99 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FNDC8Q8TC99 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNDC8Q8TC99 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNDC8Q8TC99 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNDC8Q8TC99 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FNDC8Q8TC99 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNDC8Q8TC99 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FNDC8Q8TC99 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FNDC8Q8TC99 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FNDC8Q8TC99 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FNDC8Q8TC99 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNDC8Q8TC99 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FNDC8Q8TC99 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNDC8Q8TC99 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FNDC8Q8TC99 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC8Q8TC99 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC8Q8TC99 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC8Q8TC99 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FNDC8Q8TC99 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNDC8Q8TC99 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNDC8Q8TC99 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FNDC8Q8TC99 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FNDC8Q8TC99 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FNDC8Q8TC99 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FNDC8Q8TC99 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNDC8Q8TC99 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNDC8Q8TC99 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FNDC8Q8TC99 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FNDC8Q8TC99 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FNDC8Q8TC99 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNDC8Q8TC99 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNDC8Q8TC99 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FNDC8Q8TC99 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNDC8Q8TC99 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNDC8Q8TC99 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FNDC8Q8TC99 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FNDC8Q8TC99 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNDC8Q8TC99 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FNDC8Q8TC99 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms