Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNIH3Q8TBE1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNIH3Q8TBE1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNIH3Q8TBE1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNIH3Q8TBE1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNIH3Q8TBE1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNIH3Q8TBE1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNIH3Q8TBE1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNIH3Q8TBE1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNIH3Q8TBE1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNIH3Q8TBE1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNIH3Q8TBE1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNIH3Q8TBE1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNIH3Q8TBE1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNIH3Q8TBE1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CNIH3Q8TBE1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNIH3Q8TBE1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNIH3Q8TBE1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNIH3Q8TBE1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNIH3Q8TBE1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNIH3Q8TBE1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNIH3Q8TBE1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNIH3Q8TBE1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNIH3Q8TBE1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNIH3Q8TBE1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNIH3Q8TBE1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNIH3Q8TBE1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNIH3Q8TBE1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNIH3Q8TBE1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNIH3Q8TBE1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNIH3Q8TBE1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNIH3Q8TBE1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNIH3Q8TBE1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNIH3Q8TBE1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNIH3Q8TBE1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNIH3Q8TBE1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNIH3Q8TBE1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNIH3Q8TBE1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNIH3Q8TBE1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNIH3Q8TBE1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNIH3Q8TBE1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNIH3Q8TBE1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNIH3Q8TBE1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNIH3Q8TBE1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNIH3Q8TBE1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNIH3Q8TBE1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNIH3Q8TBE1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNIH3Q8TBE1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNIH3Q8TBE1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNIH3Q8TBE1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNIH3Q8TBE1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CNIH3Q8TBE1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNIH3Q8TBE1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNIH3Q8TBE1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNIH3Q8TBE1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNIH3Q8TBE1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CNIH3Q8TBE1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNIH3Q8TBE1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNIH3Q8TBE1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNIH3Q8TBE1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNIH3Q8TBE1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNIH3Q8TBE1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNIH3Q8TBE1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNIH3Q8TBE1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNIH3Q8TBE1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNIH3Q8TBE1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNIH3Q8TBE1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNIH3Q8TBE1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNIH3Q8TBE1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNIH3Q8TBE1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNIH3Q8TBE1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNIH3Q8TBE1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNIH3Q8TBE1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNIH3Q8TBE1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNIH3Q8TBE1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNIH3Q8TBE1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNIH3Q8TBE1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNIH3Q8TBE1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNIH3Q8TBE1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNIH3Q8TBE1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNIH3Q8TBE1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNIH3Q8TBE1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNIH3Q8TBE1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNIH3Q8TBE1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNIH3Q8TBE1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNIH3Q8TBE1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNIH3Q8TBE1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNIH3Q8TBE1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNIH3Q8TBE1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNIH3Q8TBE1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNIH3Q8TBE1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CNIH3Q8TBE1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNIH3Q8TBE1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CNIH3Q8TBE1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNIH3Q8TBE1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNIH3Q8TBE1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNIH3Q8TBE1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNIH3Q8TBE1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNIH3Q8TBE1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNIH3Q8TBE1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
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