Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4H2

Arhgef12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,543 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef12Q8R4H2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Arhgef12Q8R4H2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
Arhgef12Q8R4H2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
Arhgef12Q8R4H2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
Arhgef12Q8R4H2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
Arhgef12Q8R4H2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Arhgef12Q8R4H2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Arhgef12Q8R4H2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Arhgef12Q8R4H2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC42.26■■■■■ 4.36
Arhgef12Q8R4H2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC42.26■■■■■ 4.35
Arhgef12Q8R4H2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Arhgef12Q8R4H2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Arhgef12Q8R4H2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Arhgef12Q8R4H2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Arhgef12Q8R4H2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
Arhgef12Q8R4H2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
Arhgef12Q8R4H2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Arhgef12Q8R4H2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Arhgef12Q8R4H2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
Arhgef12Q8R4H2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
Arhgef12Q8R4H2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
Arhgef12Q8R4H2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
Arhgef12Q8R4H2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Arhgef12Q8R4H2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Arhgef12Q8R4H2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
Arhgef12Q8R4H2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
Arhgef12Q8R4H2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Arhgef12Q8R4H2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Arhgef12Q8R4H2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Arhgef12Q8R4H2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
Arhgef12Q8R4H2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
Arhgef12Q8R4H2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC41.9■■■■■ 4.3
Arhgef12Q8R4H2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.9■■■■■ 4.3
Arhgef12Q8R4H2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Arhgef12Q8R4H2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Arhgef12Q8R4H2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
Arhgef12Q8R4H2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
Arhgef12Q8R4H2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
Arhgef12Q8R4H2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Arhgef12Q8R4H2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Arhgef12Q8R4H2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC41.83■■■■■ 4.29
Arhgef12Q8R4H2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC41.82■■■■■ 4.29
Arhgef12Q8R4H2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC41.81■■■■■ 4.28
Arhgef12Q8R4H2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Arhgef12Q8R4H2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Arhgef12Q8R4H2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Arhgef12Q8R4H2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Arhgef12Q8R4H2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Arhgef12Q8R4H2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
Arhgef12Q8R4H2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Arhgef12Q8R4H2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC41.7■■■■■ 4.27
Arhgef12Q8R4H2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
Arhgef12Q8R4H2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC41.7■■■■■ 4.27
Arhgef12Q8R4H2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
Arhgef12Q8R4H2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Arhgef12Q8R4H2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Arhgef12Q8R4H2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
Arhgef12Q8R4H2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Arhgef12Q8R4H2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
Arhgef12Q8R4H2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Arhgef12Q8R4H2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC41.52■■■■■ 4.24
Arhgef12Q8R4H2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Arhgef12Q8R4H2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
Arhgef12Q8R4H2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
Arhgef12Q8R4H2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
Arhgef12Q8R4H2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
Arhgef12Q8R4H2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
Arhgef12Q8R4H2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC41.39■■■■■ 4.22
Arhgef12Q8R4H2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Arhgef12Q8R4H2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Arhgef12Q8R4H2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
Arhgef12Q8R4H2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Arhgef12Q8R4H2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
Arhgef12Q8R4H2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
Arhgef12Q8R4H2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Arhgef12Q8R4H2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Arhgef12Q8R4H2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Arhgef12Q8R4H2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Arhgef12Q8R4H2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Arhgef12Q8R4H2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
Arhgef12Q8R4H2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
Arhgef12Q8R4H2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.16
Arhgef12Q8R4H2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
Arhgef12Q8R4H2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Arhgef12Q8R4H2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Arhgef12Q8R4H2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
Arhgef12Q8R4H2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Arhgef12Q8R4H2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Arhgef12Q8R4H2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Arhgef12Q8R4H2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
Arhgef12Q8R4H2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC40.84■■■■■ 4.13
Arhgef12Q8R4H2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.12
Arhgef12Q8R4H2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Arhgef12Q8R4H2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
Arhgef12Q8R4H2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Arhgef12Q8R4H2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
Arhgef12Q8R4H2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Arhgef12Q8R4H2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Arhgef12Q8R4H2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Arhgef12Q8R4H2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms