Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4F0

Mcoln3, Mucolipin-3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln3Q8R4F0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mcoln3Q8R4F0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Mcoln3Q8R4F0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mcoln3Q8R4F0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mcoln3Q8R4F0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Mcoln3Q8R4F0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mcoln3Q8R4F0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mcoln3Q8R4F0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mcoln3Q8R4F0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mcoln3Q8R4F0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mcoln3Q8R4F0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mcoln3Q8R4F0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Mcoln3Q8R4F0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mcoln3Q8R4F0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mcoln3Q8R4F0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mcoln3Q8R4F0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mcoln3Q8R4F0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mcoln3Q8R4F0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mcoln3Q8R4F0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mcoln3Q8R4F0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Mcoln3Q8R4F0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mcoln3Q8R4F0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Mcoln3Q8R4F0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Mcoln3Q8R4F0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Mcoln3Q8R4F0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Mcoln3Q8R4F0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mcoln3Q8R4F0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mcoln3Q8R4F0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mcoln3Q8R4F0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mcoln3Q8R4F0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mcoln3Q8R4F0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mcoln3Q8R4F0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mcoln3Q8R4F0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mcoln3Q8R4F0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mcoln3Q8R4F0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mcoln3Q8R4F0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mcoln3Q8R4F0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mcoln3Q8R4F0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mcoln3Q8R4F0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mcoln3Q8R4F0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mcoln3Q8R4F0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Mcoln3Q8R4F0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mcoln3Q8R4F0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mcoln3Q8R4F0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mcoln3Q8R4F0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mcoln3Q8R4F0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Mcoln3Q8R4F0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Mcoln3Q8R4F0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mcoln3Q8R4F0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mcoln3Q8R4F0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mcoln3Q8R4F0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mcoln3Q8R4F0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mcoln3Q8R4F0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mcoln3Q8R4F0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mcoln3Q8R4F0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Mcoln3Q8R4F0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mcoln3Q8R4F0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mcoln3Q8R4F0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mcoln3Q8R4F0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mcoln3Q8R4F0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mcoln3Q8R4F0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mcoln3Q8R4F0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mcoln3Q8R4F0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mcoln3Q8R4F0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mcoln3Q8R4F0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mcoln3Q8R4F0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Mcoln3Q8R4F0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mcoln3Q8R4F0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mcoln3Q8R4F0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mcoln3Q8R4F0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mcoln3Q8R4F0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mcoln3Q8R4F0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mcoln3Q8R4F0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mcoln3Q8R4F0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mcoln3Q8R4F0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mcoln3Q8R4F0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mcoln3Q8R4F0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Mcoln3Q8R4F0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mcoln3Q8R4F0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mcoln3Q8R4F0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mcoln3Q8R4F0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mcoln3Q8R4F0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mcoln3Q8R4F0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mcoln3Q8R4F0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mcoln3Q8R4F0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mcoln3Q8R4F0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mcoln3Q8R4F0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mcoln3Q8R4F0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mcoln3Q8R4F0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mcoln3Q8R4F0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mcoln3Q8R4F0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mcoln3Q8R4F0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mcoln3Q8R4F0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mcoln3Q8R4F0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mcoln3Q8R4F0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mcoln3Q8R4F0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mcoln3Q8R4F0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mcoln3Q8R4F0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mcoln3Q8R4F0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mcoln3Q8R4F0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms