Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP61Q8NHU2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP61Q8NHU2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP61Q8NHU2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP61Q8NHU2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP61Q8NHU2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP61Q8NHU2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP61Q8NHU2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFAP61Q8NHU2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFAP61Q8NHU2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFAP61Q8NHU2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFAP61Q8NHU2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP61Q8NHU2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFAP61Q8NHU2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFAP61Q8NHU2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFAP61Q8NHU2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP61Q8NHU2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP61Q8NHU2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP61Q8NHU2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP61Q8NHU2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFAP61Q8NHU2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP61Q8NHU2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CFAP61Q8NHU2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP61Q8NHU2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP61Q8NHU2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CFAP61Q8NHU2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CFAP61Q8NHU2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP61Q8NHU2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP61Q8NHU2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CFAP61Q8NHU2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CFAP61Q8NHU2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CFAP61Q8NHU2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP61Q8NHU2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CFAP61Q8NHU2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CFAP61Q8NHU2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CFAP61Q8NHU2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP61Q8NHU2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP61Q8NHU2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP61Q8NHU2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP61Q8NHU2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP61Q8NHU2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP61Q8NHU2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP61Q8NHU2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP61Q8NHU2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP61Q8NHU2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP61Q8NHU2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP61Q8NHU2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP61Q8NHU2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP61Q8NHU2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP61Q8NHU2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP61Q8NHU2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP61Q8NHU2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP61Q8NHU2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP61Q8NHU2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP61Q8NHU2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP61Q8NHU2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP61Q8NHU2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP61Q8NHU2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP61Q8NHU2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP61Q8NHU2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP61Q8NHU2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP61Q8NHU2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP61Q8NHU2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP61Q8NHU2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CFAP61Q8NHU2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP61Q8NHU2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP61Q8NHU2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP61Q8NHU2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP61Q8NHU2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CFAP61Q8NHU2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CFAP61Q8NHU2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CFAP61Q8NHU2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CFAP61Q8NHU2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CFAP61Q8NHU2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CFAP61Q8NHU2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFAP61Q8NHU2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFAP61Q8NHU2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFAP61Q8NHU2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFAP61Q8NHU2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFAP61Q8NHU2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFAP61Q8NHU2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFAP61Q8NHU2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFAP61Q8NHU2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFAP61Q8NHU2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP61Q8NHU2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP61Q8NHU2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFAP61Q8NHU2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFAP61Q8NHU2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFAP61Q8NHU2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP61Q8NHU2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP61Q8NHU2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP61Q8NHU2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP61Q8NHU2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP61Q8NHU2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP61Q8NHU2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP61Q8NHU2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP61Q8NHU2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP61Q8NHU2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP61Q8NHU2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP61Q8NHU2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms