Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP3

DNAAF1, Dynein assembly factor 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF1Q8NEP3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAAF1Q8NEP3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAAF1Q8NEP3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAAF1Q8NEP3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAAF1Q8NEP3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAAF1Q8NEP3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAAF1Q8NEP3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAAF1Q8NEP3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAAF1Q8NEP3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAAF1Q8NEP3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAAF1Q8NEP3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF1Q8NEP3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAAF1Q8NEP3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAAF1Q8NEP3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAAF1Q8NEP3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DNAAF1Q8NEP3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAAF1Q8NEP3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAAF1Q8NEP3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAAF1Q8NEP3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAAF1Q8NEP3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAAF1Q8NEP3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAAF1Q8NEP3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAAF1Q8NEP3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAAF1Q8NEP3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DNAAF1Q8NEP3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAAF1Q8NEP3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF1Q8NEP3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF1Q8NEP3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF1Q8NEP3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DNAAF1Q8NEP3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAAF1Q8NEP3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAAF1Q8NEP3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DNAAF1Q8NEP3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DNAAF1Q8NEP3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DNAAF1Q8NEP3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAAF1Q8NEP3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAAF1Q8NEP3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DNAAF1Q8NEP3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DNAAF1Q8NEP3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DNAAF1Q8NEP3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DNAAF1Q8NEP3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAAF1Q8NEP3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DNAAF1Q8NEP3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAAF1Q8NEP3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAAF1Q8NEP3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNAAF1Q8NEP3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNAAF1Q8NEP3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF1Q8NEP3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF1Q8NEP3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNAAF1Q8NEP3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAAF1Q8NEP3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAAF1Q8NEP3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAAF1Q8NEP3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAAF1Q8NEP3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAAF1Q8NEP3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAAF1Q8NEP3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAAF1Q8NEP3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAAF1Q8NEP3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF1Q8NEP3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF1Q8NEP3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAAF1Q8NEP3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAAF1Q8NEP3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAAF1Q8NEP3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAAF1Q8NEP3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAAF1Q8NEP3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAAF1Q8NEP3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNAAF1Q8NEP3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAAF1Q8NEP3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAAF1Q8NEP3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNAAF1Q8NEP3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNAAF1Q8NEP3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNAAF1Q8NEP3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNAAF1Q8NEP3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNAAF1Q8NEP3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAAF1Q8NEP3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNAAF1Q8NEP3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAAF1Q8NEP3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DNAAF1Q8NEP3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF1Q8NEP3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DNAAF1Q8NEP3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DNAAF1Q8NEP3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNAAF1Q8NEP3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNAAF1Q8NEP3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNAAF1Q8NEP3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DNAAF1Q8NEP3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAAF1Q8NEP3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DNAAF1Q8NEP3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DNAAF1Q8NEP3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAAF1Q8NEP3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAAF1Q8NEP3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAAF1Q8NEP3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DNAAF1Q8NEP3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF1Q8NEP3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF1Q8NEP3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF1Q8NEP3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DNAAF1Q8NEP3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAAF1Q8NEP3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DNAAF1Q8NEP3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF1Q8NEP3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DNAAF1Q8NEP3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms