Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NHLRC2Q8NBF2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NHLRC2Q8NBF2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NHLRC2Q8NBF2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NHLRC2Q8NBF2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NHLRC2Q8NBF2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NHLRC2Q8NBF2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NHLRC2Q8NBF2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NHLRC2Q8NBF2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NHLRC2Q8NBF2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NHLRC2Q8NBF2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NHLRC2Q8NBF2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NHLRC2Q8NBF2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NHLRC2Q8NBF2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NHLRC2Q8NBF2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NHLRC2Q8NBF2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NHLRC2Q8NBF2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NHLRC2Q8NBF2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHLRC2Q8NBF2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHLRC2Q8NBF2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NHLRC2Q8NBF2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NHLRC2Q8NBF2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NHLRC2Q8NBF2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NHLRC2Q8NBF2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NHLRC2Q8NBF2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NHLRC2Q8NBF2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NHLRC2Q8NBF2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NHLRC2Q8NBF2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NHLRC2Q8NBF2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NHLRC2Q8NBF2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NHLRC2Q8NBF2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NHLRC2Q8NBF2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NHLRC2Q8NBF2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NHLRC2Q8NBF2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NHLRC2Q8NBF2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NHLRC2Q8NBF2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NHLRC2Q8NBF2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NHLRC2Q8NBF2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NHLRC2Q8NBF2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NHLRC2Q8NBF2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NHLRC2Q8NBF2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NHLRC2Q8NBF2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NHLRC2Q8NBF2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NHLRC2Q8NBF2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NHLRC2Q8NBF2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NHLRC2Q8NBF2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NHLRC2Q8NBF2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NHLRC2Q8NBF2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NHLRC2Q8NBF2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NHLRC2Q8NBF2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NHLRC2Q8NBF2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHLRC2Q8NBF2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NHLRC2Q8NBF2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NHLRC2Q8NBF2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NHLRC2Q8NBF2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NHLRC2Q8NBF2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NHLRC2Q8NBF2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NHLRC2Q8NBF2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NHLRC2Q8NBF2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NHLRC2Q8NBF2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NHLRC2Q8NBF2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NHLRC2Q8NBF2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NHLRC2Q8NBF2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NHLRC2Q8NBF2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NHLRC2Q8NBF2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NHLRC2Q8NBF2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NHLRC2Q8NBF2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NHLRC2Q8NBF2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NHLRC2Q8NBF2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NHLRC2Q8NBF2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NHLRC2Q8NBF2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NHLRC2Q8NBF2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NHLRC2Q8NBF2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NHLRC2Q8NBF2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NHLRC2Q8NBF2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NHLRC2Q8NBF2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NHLRC2Q8NBF2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NHLRC2Q8NBF2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NHLRC2Q8NBF2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NHLRC2Q8NBF2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NHLRC2Q8NBF2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NHLRC2Q8NBF2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NHLRC2Q8NBF2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NHLRC2Q8NBF2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NHLRC2Q8NBF2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NHLRC2Q8NBF2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NHLRC2Q8NBF2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NHLRC2Q8NBF2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NHLRC2Q8NBF2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NHLRC2Q8NBF2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NHLRC2Q8NBF2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NHLRC2Q8NBF2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NHLRC2Q8NBF2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NHLRC2Q8NBF2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NHLRC2Q8NBF2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NHLRC2Q8NBF2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NHLRC2Q8NBF2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NHLRC2Q8NBF2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NHLRC2Q8NBF2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NHLRC2Q8NBF2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms