Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB49

ATP11C, Phospholipid-transporting ATPase IG, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11CQ8NB49 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ATP11CQ8NB49 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATP11CQ8NB49 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP11CQ8NB49 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP11CQ8NB49 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ATP11CQ8NB49 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP11CQ8NB49 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP11CQ8NB49 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP11CQ8NB49 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP11CQ8NB49 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP11CQ8NB49 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP11CQ8NB49 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP11CQ8NB49 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP11CQ8NB49 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP11CQ8NB49 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP11CQ8NB49 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP11CQ8NB49 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP11CQ8NB49 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP11CQ8NB49 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP11CQ8NB49 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP11CQ8NB49 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP11CQ8NB49 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP11CQ8NB49 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP11CQ8NB49 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP11CQ8NB49 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP11CQ8NB49 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP11CQ8NB49 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP11CQ8NB49 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP11CQ8NB49 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP11CQ8NB49 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP11CQ8NB49 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP11CQ8NB49 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP11CQ8NB49 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP11CQ8NB49 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP11CQ8NB49 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP11CQ8NB49 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP11CQ8NB49 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP11CQ8NB49 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP11CQ8NB49 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP11CQ8NB49 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP11CQ8NB49 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP11CQ8NB49 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP11CQ8NB49 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP11CQ8NB49 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP11CQ8NB49 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP11CQ8NB49 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP11CQ8NB49 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP11CQ8NB49 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP11CQ8NB49 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP11CQ8NB49 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP11CQ8NB49 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP11CQ8NB49 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP11CQ8NB49 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP11CQ8NB49 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP11CQ8NB49 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP11CQ8NB49 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP11CQ8NB49 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP11CQ8NB49 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP11CQ8NB49 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP11CQ8NB49 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP11CQ8NB49 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP11CQ8NB49 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP11CQ8NB49 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ATP11CQ8NB49 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP11CQ8NB49 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP11CQ8NB49 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP11CQ8NB49 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP11CQ8NB49 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP11CQ8NB49 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP11CQ8NB49 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP11CQ8NB49 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP11CQ8NB49 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP11CQ8NB49 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP11CQ8NB49 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP11CQ8NB49 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP11CQ8NB49 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP11CQ8NB49 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP11CQ8NB49 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP11CQ8NB49 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP11CQ8NB49 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP11CQ8NB49 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP11CQ8NB49 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP11CQ8NB49 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP11CQ8NB49 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP11CQ8NB49 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP11CQ8NB49 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP11CQ8NB49 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP11CQ8NB49 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP11CQ8NB49 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP11CQ8NB49 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP11CQ8NB49 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP11CQ8NB49 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP11CQ8NB49 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP11CQ8NB49 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP11CQ8NB49 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP11CQ8NB49 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP11CQ8NB49 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP11CQ8NB49 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP11CQ8NB49 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP11CQ8NB49 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms