Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7P3

CLDN22, Claudin-22, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN22Q8N7P3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN22Q8N7P3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN22Q8N7P3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN22Q8N7P3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN22Q8N7P3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN22Q8N7P3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN22Q8N7P3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN22Q8N7P3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN22Q8N7P3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN22Q8N7P3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN22Q8N7P3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN22Q8N7P3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN22Q8N7P3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN22Q8N7P3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLDN22Q8N7P3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN22Q8N7P3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN22Q8N7P3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN22Q8N7P3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN22Q8N7P3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN22Q8N7P3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN22Q8N7P3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDN22Q8N7P3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDN22Q8N7P3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDN22Q8N7P3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDN22Q8N7P3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN22Q8N7P3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN22Q8N7P3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN22Q8N7P3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLDN22Q8N7P3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN22Q8N7P3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN22Q8N7P3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN22Q8N7P3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN22Q8N7P3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN22Q8N7P3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN22Q8N7P3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN22Q8N7P3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN22Q8N7P3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLDN22Q8N7P3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CLDN22Q8N7P3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLDN22Q8N7P3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN22Q8N7P3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN22Q8N7P3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN22Q8N7P3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN22Q8N7P3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN22Q8N7P3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN22Q8N7P3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN22Q8N7P3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN22Q8N7P3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN22Q8N7P3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN22Q8N7P3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN22Q8N7P3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN22Q8N7P3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN22Q8N7P3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN22Q8N7P3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN22Q8N7P3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN22Q8N7P3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN22Q8N7P3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN22Q8N7P3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN22Q8N7P3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN22Q8N7P3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN22Q8N7P3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN22Q8N7P3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN22Q8N7P3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN22Q8N7P3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN22Q8N7P3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN22Q8N7P3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN22Q8N7P3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN22Q8N7P3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN22Q8N7P3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN22Q8N7P3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN22Q8N7P3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN22Q8N7P3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN22Q8N7P3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN22Q8N7P3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN22Q8N7P3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLDN22Q8N7P3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN22Q8N7P3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN22Q8N7P3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN22Q8N7P3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN22Q8N7P3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN22Q8N7P3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN22Q8N7P3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN22Q8N7P3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN22Q8N7P3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN22Q8N7P3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN22Q8N7P3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN22Q8N7P3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN22Q8N7P3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN22Q8N7P3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN22Q8N7P3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN22Q8N7P3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN22Q8N7P3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN22Q8N7P3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN22Q8N7P3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN22Q8N7P3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN22Q8N7P3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN22Q8N7P3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN22Q8N7P3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN22Q8N7P3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN22Q8N7P3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms