Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6M8

IQCF1, IQ domain-containing protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCF1Q8N6M8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IQCF1Q8N6M8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IQCF1Q8N6M8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IQCF1Q8N6M8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IQCF1Q8N6M8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IQCF1Q8N6M8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IQCF1Q8N6M8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IQCF1Q8N6M8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQCF1Q8N6M8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IQCF1Q8N6M8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IQCF1Q8N6M8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IQCF1Q8N6M8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IQCF1Q8N6M8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQCF1Q8N6M8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IQCF1Q8N6M8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
IQCF1Q8N6M8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IQCF1Q8N6M8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IQCF1Q8N6M8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IQCF1Q8N6M8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IQCF1Q8N6M8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IQCF1Q8N6M8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IQCF1Q8N6M8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IQCF1Q8N6M8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IQCF1Q8N6M8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IQCF1Q8N6M8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IQCF1Q8N6M8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IQCF1Q8N6M8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IQCF1Q8N6M8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IQCF1Q8N6M8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IQCF1Q8N6M8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
IQCF1Q8N6M8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IQCF1Q8N6M8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IQCF1Q8N6M8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IQCF1Q8N6M8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IQCF1Q8N6M8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IQCF1Q8N6M8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IQCF1Q8N6M8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IQCF1Q8N6M8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IQCF1Q8N6M8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IQCF1Q8N6M8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IQCF1Q8N6M8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IQCF1Q8N6M8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IQCF1Q8N6M8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IQCF1Q8N6M8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IQCF1Q8N6M8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IQCF1Q8N6M8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IQCF1Q8N6M8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IQCF1Q8N6M8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IQCF1Q8N6M8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IQCF1Q8N6M8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IQCF1Q8N6M8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IQCF1Q8N6M8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IQCF1Q8N6M8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IQCF1Q8N6M8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IQCF1Q8N6M8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IQCF1Q8N6M8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IQCF1Q8N6M8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IQCF1Q8N6M8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IQCF1Q8N6M8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IQCF1Q8N6M8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IQCF1Q8N6M8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IQCF1Q8N6M8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IQCF1Q8N6M8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IQCF1Q8N6M8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IQCF1Q8N6M8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IQCF1Q8N6M8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IQCF1Q8N6M8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IQCF1Q8N6M8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IQCF1Q8N6M8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IQCF1Q8N6M8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IQCF1Q8N6M8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IQCF1Q8N6M8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IQCF1Q8N6M8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IQCF1Q8N6M8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IQCF1Q8N6M8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IQCF1Q8N6M8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IQCF1Q8N6M8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IQCF1Q8N6M8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
IQCF1Q8N6M8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IQCF1Q8N6M8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
IQCF1Q8N6M8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IQCF1Q8N6M8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IQCF1Q8N6M8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IQCF1Q8N6M8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IQCF1Q8N6M8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IQCF1Q8N6M8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IQCF1Q8N6M8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IQCF1Q8N6M8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IQCF1Q8N6M8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IQCF1Q8N6M8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IQCF1Q8N6M8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IQCF1Q8N6M8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IQCF1Q8N6M8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IQCF1Q8N6M8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IQCF1Q8N6M8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IQCF1Q8N6M8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IQCF1Q8N6M8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IQCF1Q8N6M8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IQCF1Q8N6M8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IQCF1Q8N6M8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms