Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM71E2Q8N5Q1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71E2Q8N5Q1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71E2Q8N5Q1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM71E2Q8N5Q1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM71E2Q8N5Q1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71E2Q8N5Q1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71E2Q8N5Q1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71E2Q8N5Q1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71E2Q8N5Q1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71E2Q8N5Q1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71E2Q8N5Q1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71E2Q8N5Q1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM71E2Q8N5Q1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM71E2Q8N5Q1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM71E2Q8N5Q1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM71E2Q8N5Q1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM71E2Q8N5Q1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM71E2Q8N5Q1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM71E2Q8N5Q1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM71E2Q8N5Q1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM71E2Q8N5Q1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM71E2Q8N5Q1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM71E2Q8N5Q1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM71E2Q8N5Q1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM71E2Q8N5Q1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM71E2Q8N5Q1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM71E2Q8N5Q1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM71E2Q8N5Q1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM71E2Q8N5Q1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM71E2Q8N5Q1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM71E2Q8N5Q1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71E2Q8N5Q1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM71E2Q8N5Q1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM71E2Q8N5Q1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71E2Q8N5Q1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM71E2Q8N5Q1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71E2Q8N5Q1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM71E2Q8N5Q1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM71E2Q8N5Q1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM71E2Q8N5Q1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM71E2Q8N5Q1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM71E2Q8N5Q1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM71E2Q8N5Q1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM71E2Q8N5Q1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM71E2Q8N5Q1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM71E2Q8N5Q1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM71E2Q8N5Q1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM71E2Q8N5Q1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM71E2Q8N5Q1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM71E2Q8N5Q1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM71E2Q8N5Q1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM71E2Q8N5Q1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM71E2Q8N5Q1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM71E2Q8N5Q1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM71E2Q8N5Q1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71E2Q8N5Q1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71E2Q8N5Q1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM71E2Q8N5Q1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM71E2Q8N5Q1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM71E2Q8N5Q1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71E2Q8N5Q1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71E2Q8N5Q1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71E2Q8N5Q1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM71E2Q8N5Q1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM71E2Q8N5Q1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM71E2Q8N5Q1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM71E2Q8N5Q1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM71E2Q8N5Q1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM71E2Q8N5Q1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM71E2Q8N5Q1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM71E2Q8N5Q1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM71E2Q8N5Q1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM71E2Q8N5Q1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71E2Q8N5Q1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71E2Q8N5Q1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71E2Q8N5Q1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71E2Q8N5Q1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71E2Q8N5Q1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM71E2Q8N5Q1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71E2Q8N5Q1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71E2Q8N5Q1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM71E2Q8N5Q1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM71E2Q8N5Q1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM71E2Q8N5Q1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM71E2Q8N5Q1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM71E2Q8N5Q1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM71E2Q8N5Q1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM71E2Q8N5Q1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM71E2Q8N5Q1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM71E2Q8N5Q1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM71E2Q8N5Q1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM71E2Q8N5Q1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM71E2Q8N5Q1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM71E2Q8N5Q1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM71E2Q8N5Q1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM71E2Q8N5Q1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM71E2Q8N5Q1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms