Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4K4

RPRML, Reprimo-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMLQ8N4K4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPRMLQ8N4K4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPRMLQ8N4K4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPRMLQ8N4K4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPRMLQ8N4K4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPRMLQ8N4K4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPRMLQ8N4K4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RPRMLQ8N4K4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPRMLQ8N4K4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPRMLQ8N4K4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPRMLQ8N4K4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPRMLQ8N4K4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPRMLQ8N4K4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RPRMLQ8N4K4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPRMLQ8N4K4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPRMLQ8N4K4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPRMLQ8N4K4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPRMLQ8N4K4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPRMLQ8N4K4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPRMLQ8N4K4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPRMLQ8N4K4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPRMLQ8N4K4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPRMLQ8N4K4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPRMLQ8N4K4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPRMLQ8N4K4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPRMLQ8N4K4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RPRMLQ8N4K4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPRMLQ8N4K4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPRMLQ8N4K4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RPRMLQ8N4K4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPRMLQ8N4K4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPRMLQ8N4K4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPRMLQ8N4K4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPRMLQ8N4K4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPRMLQ8N4K4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPRMLQ8N4K4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPRMLQ8N4K4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPRMLQ8N4K4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPRMLQ8N4K4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPRMLQ8N4K4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPRMLQ8N4K4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPRMLQ8N4K4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPRMLQ8N4K4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPRMLQ8N4K4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPRMLQ8N4K4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RPRMLQ8N4K4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPRMLQ8N4K4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPRMLQ8N4K4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPRMLQ8N4K4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RPRMLQ8N4K4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPRMLQ8N4K4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPRMLQ8N4K4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPRMLQ8N4K4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPRMLQ8N4K4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPRMLQ8N4K4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPRMLQ8N4K4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPRMLQ8N4K4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPRMLQ8N4K4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPRMLQ8N4K4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPRMLQ8N4K4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPRMLQ8N4K4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPRMLQ8N4K4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPRMLQ8N4K4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPRMLQ8N4K4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPRMLQ8N4K4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPRMLQ8N4K4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPRMLQ8N4K4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPRMLQ8N4K4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RPRMLQ8N4K4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RPRMLQ8N4K4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RPRMLQ8N4K4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPRMLQ8N4K4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPRMLQ8N4K4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPRMLQ8N4K4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPRMLQ8N4K4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPRMLQ8N4K4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPRMLQ8N4K4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPRMLQ8N4K4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPRMLQ8N4K4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPRMLQ8N4K4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RPRMLQ8N4K4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPRMLQ8N4K4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPRMLQ8N4K4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPRMLQ8N4K4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPRMLQ8N4K4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPRMLQ8N4K4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPRMLQ8N4K4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPRMLQ8N4K4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RPRMLQ8N4K4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPRMLQ8N4K4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPRMLQ8N4K4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPRMLQ8N4K4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPRMLQ8N4K4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPRMLQ8N4K4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RPRMLQ8N4K4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPRMLQ8N4K4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPRMLQ8N4K4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPRMLQ8N4K4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPRMLQ8N4K4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPRMLQ8N4K4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms