Protein–RNA interactions for Protein: Q8N468

MFSD4A, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD4AQ8N468 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MFSD4AQ8N468 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MFSD4AQ8N468 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MFSD4AQ8N468 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MFSD4AQ8N468 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MFSD4AQ8N468 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MFSD4AQ8N468 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MFSD4AQ8N468 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MFSD4AQ8N468 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MFSD4AQ8N468 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MFSD4AQ8N468 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MFSD4AQ8N468 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MFSD4AQ8N468 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MFSD4AQ8N468 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MFSD4AQ8N468 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MFSD4AQ8N468 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MFSD4AQ8N468 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MFSD4AQ8N468 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MFSD4AQ8N468 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MFSD4AQ8N468 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MFSD4AQ8N468 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MFSD4AQ8N468 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MFSD4AQ8N468 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MFSD4AQ8N468 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MFSD4AQ8N468 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MFSD4AQ8N468 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MFSD4AQ8N468 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MFSD4AQ8N468 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MFSD4AQ8N468 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MFSD4AQ8N468 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MFSD4AQ8N468 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MFSD4AQ8N468 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MFSD4AQ8N468 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MFSD4AQ8N468 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MFSD4AQ8N468 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MFSD4AQ8N468 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MFSD4AQ8N468 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MFSD4AQ8N468 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MFSD4AQ8N468 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MFSD4AQ8N468 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MFSD4AQ8N468 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFSD4AQ8N468 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFSD4AQ8N468 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFSD4AQ8N468 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFSD4AQ8N468 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFSD4AQ8N468 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFSD4AQ8N468 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFSD4AQ8N468 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFSD4AQ8N468 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MFSD4AQ8N468 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MFSD4AQ8N468 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MFSD4AQ8N468 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MFSD4AQ8N468 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MFSD4AQ8N468 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MFSD4AQ8N468 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MFSD4AQ8N468 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MFSD4AQ8N468 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MFSD4AQ8N468 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MFSD4AQ8N468 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MFSD4AQ8N468 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MFSD4AQ8N468 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MFSD4AQ8N468 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MFSD4AQ8N468 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MFSD4AQ8N468 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MFSD4AQ8N468 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MFSD4AQ8N468 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MFSD4AQ8N468 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MFSD4AQ8N468 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MFSD4AQ8N468 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MFSD4AQ8N468 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD4AQ8N468 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD4AQ8N468 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MFSD4AQ8N468 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MFSD4AQ8N468 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MFSD4AQ8N468 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MFSD4AQ8N468 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MFSD4AQ8N468 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD4AQ8N468 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MFSD4AQ8N468 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFSD4AQ8N468 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFSD4AQ8N468 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFSD4AQ8N468 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFSD4AQ8N468 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFSD4AQ8N468 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFSD4AQ8N468 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFSD4AQ8N468 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFSD4AQ8N468 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFSD4AQ8N468 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MFSD4AQ8N468 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFSD4AQ8N468 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFSD4AQ8N468 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFSD4AQ8N468 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFSD4AQ8N468 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFSD4AQ8N468 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD4AQ8N468 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD4AQ8N468 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFSD4AQ8N468 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MFSD4AQ8N468 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFSD4AQ8N468 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD4AQ8N468 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms