Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP4Q8N3C7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP4Q8N3C7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP4Q8N3C7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP4Q8N3C7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP4Q8N3C7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLIP4Q8N3C7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLIP4Q8N3C7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLIP4Q8N3C7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLIP4Q8N3C7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP4Q8N3C7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP4Q8N3C7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLIP4Q8N3C7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLIP4Q8N3C7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP4Q8N3C7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP4Q8N3C7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLIP4Q8N3C7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLIP4Q8N3C7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP4Q8N3C7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP4Q8N3C7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLIP4Q8N3C7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP4Q8N3C7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP4Q8N3C7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP4Q8N3C7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLIP4Q8N3C7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLIP4Q8N3C7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIP4Q8N3C7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIP4Q8N3C7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIP4Q8N3C7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CLIP4Q8N3C7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLIP4Q8N3C7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP4Q8N3C7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLIP4Q8N3C7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP4Q8N3C7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLIP4Q8N3C7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLIP4Q8N3C7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLIP4Q8N3C7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP4Q8N3C7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLIP4Q8N3C7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLIP4Q8N3C7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP4Q8N3C7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLIP4Q8N3C7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP4Q8N3C7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP4Q8N3C7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLIP4Q8N3C7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP4Q8N3C7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP4Q8N3C7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP4Q8N3C7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP4Q8N3C7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP4Q8N3C7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP4Q8N3C7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP4Q8N3C7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP4Q8N3C7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP4Q8N3C7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP4Q8N3C7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP4Q8N3C7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP4Q8N3C7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP4Q8N3C7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP4Q8N3C7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP4Q8N3C7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP4Q8N3C7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP4Q8N3C7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLIP4Q8N3C7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP4Q8N3C7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP4Q8N3C7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIP4Q8N3C7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIP4Q8N3C7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIP4Q8N3C7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP4Q8N3C7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP4Q8N3C7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP4Q8N3C7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP4Q8N3C7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLIP4Q8N3C7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLIP4Q8N3C7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLIP4Q8N3C7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP4Q8N3C7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLIP4Q8N3C7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLIP4Q8N3C7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIP4Q8N3C7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIP4Q8N3C7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIP4Q8N3C7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIP4Q8N3C7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIP4Q8N3C7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIP4Q8N3C7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIP4Q8N3C7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIP4Q8N3C7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP4Q8N3C7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIP4Q8N3C7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIP4Q8N3C7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLIP4Q8N3C7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP4Q8N3C7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLIP4Q8N3C7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP4Q8N3C7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP4Q8N3C7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP4Q8N3C7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLIP4Q8N3C7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIP4Q8N3C7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIP4Q8N3C7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIP4Q8N3C7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIP4Q8N3C7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms