Protein–RNA interactions for Protein: Q8N183

NDUFAF2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF2Q8N183 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NDUFAF2Q8N183 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NDUFAF2Q8N183 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NDUFAF2Q8N183 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NDUFAF2Q8N183 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NDUFAF2Q8N183 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NDUFAF2Q8N183 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NDUFAF2Q8N183 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NDUFAF2Q8N183 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NDUFAF2Q8N183 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NDUFAF2Q8N183 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NDUFAF2Q8N183 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NDUFAF2Q8N183 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NDUFAF2Q8N183 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NDUFAF2Q8N183 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NDUFAF2Q8N183 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NDUFAF2Q8N183 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NDUFAF2Q8N183 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NDUFAF2Q8N183 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NDUFAF2Q8N183 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NDUFAF2Q8N183 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NDUFAF2Q8N183 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NDUFAF2Q8N183 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NDUFAF2Q8N183 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NDUFAF2Q8N183 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NDUFAF2Q8N183 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NDUFAF2Q8N183 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NDUFAF2Q8N183 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NDUFAF2Q8N183 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NDUFAF2Q8N183 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NDUFAF2Q8N183 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NDUFAF2Q8N183 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NDUFAF2Q8N183 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NDUFAF2Q8N183 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NDUFAF2Q8N183 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NDUFAF2Q8N183 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NDUFAF2Q8N183 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NDUFAF2Q8N183 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NDUFAF2Q8N183 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NDUFAF2Q8N183 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NDUFAF2Q8N183 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NDUFAF2Q8N183 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NDUFAF2Q8N183 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NDUFAF2Q8N183 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NDUFAF2Q8N183 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NDUFAF2Q8N183 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NDUFAF2Q8N183 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NDUFAF2Q8N183 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NDUFAF2Q8N183 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NDUFAF2Q8N183 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NDUFAF2Q8N183 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NDUFAF2Q8N183 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NDUFAF2Q8N183 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NDUFAF2Q8N183 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NDUFAF2Q8N183 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NDUFAF2Q8N183 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NDUFAF2Q8N183 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NDUFAF2Q8N183 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NDUFAF2Q8N183 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NDUFAF2Q8N183 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NDUFAF2Q8N183 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NDUFAF2Q8N183 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NDUFAF2Q8N183 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NDUFAF2Q8N183 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NDUFAF2Q8N183 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NDUFAF2Q8N183 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NDUFAF2Q8N183 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NDUFAF2Q8N183 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NDUFAF2Q8N183 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NDUFAF2Q8N183 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NDUFAF2Q8N183 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NDUFAF2Q8N183 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NDUFAF2Q8N183 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NDUFAF2Q8N183 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NDUFAF2Q8N183 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NDUFAF2Q8N183 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NDUFAF2Q8N183 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NDUFAF2Q8N183 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NDUFAF2Q8N183 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NDUFAF2Q8N183 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NDUFAF2Q8N183 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NDUFAF2Q8N183 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NDUFAF2Q8N183 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NDUFAF2Q8N183 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NDUFAF2Q8N183 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NDUFAF2Q8N183 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NDUFAF2Q8N183 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NDUFAF2Q8N183 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NDUFAF2Q8N183 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NDUFAF2Q8N183 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NDUFAF2Q8N183 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NDUFAF2Q8N183 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NDUFAF2Q8N183 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NDUFAF2Q8N183 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NDUFAF2Q8N183 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NDUFAF2Q8N183 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NDUFAF2Q8N183 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NDUFAF2Q8N183 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NDUFAF2Q8N183 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NDUFAF2Q8N183 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms